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Norme de référence de typage moléculaire précis du cancer de l'endomètre

Vues : 0 Auteur : Éditeur du site Heure de publication : 2024-04-11 Origine : Site

Renseigner

En 2013, le Cancer Genome Atlas (TCGA) a classé le cancer de l'endomètre en quatre sous-types sur la base d'analyses multi-omiques, y compris des analyses du génome entier, du transcriptome et du protéome : mutation POLE, mutation d'instabilité des microsatellites, sous-type à faible nombre de copies et sous-type à nombre de copies élevé. Les recommandations de stadification de la Fédération internationale de gynécologie et d'obstétrique (FIGO) de 2023 exigent que toutes les patientes atteintes d'un cancer de l'endomètre (CE) subissent des tests de sous-type moléculaire.

Le 29 janvier 2024, le National Comprehensive Cancer Network (NCCN) a mis à jour ses lignes directrices pour les cancers du côlon et du rectum vers la version 2024.V1. Par rapport aux lignes directrices 2023 V6 NCCN, la version 2024 V1 a ajouté pour la première fois des tests moléculaires pour les mutations POLE et POLD1 et les gènes de fusion RET.

Gène POLE Introduction

Le gène POLE, situé en 12q24.33, se compose de 63 762 paires de bases et englobe 51 exons. Il code pour la sous-unité catalytique de l'ADN polymérase Pol epsilon, qui comprend un domaine catalytique et un domaine exonucléase et est crucial pour la relecture lors de la réplication de l'ADN. Lorsque des mutations pathogènes se produisent dans le domaine exonucléase du gène POLE, empêchant la protéine d'effectuer en temps opportun une relecture des erreurs lors de la réplication de l'ADN, le génome tumoral accumule de nombreuses erreurs de réplication au cours de la prolifération cellulaire, entraînant une fréquence de mutation 10 à 100 fois supérieure à celle des cellules normales (généralement <10 mutations/Mb). Une mutation POLE n'est diagnostiquée que lorsqu'une mutation pathogène dans le domaine exonucléase (exons 9-14) est détectée dans une tumeur. Les mutations du gène pôle peuvent conduire à une tumorigenèse.

Les études actuelles ont montré que, malgré la morphologie hautement maligne des tumeurs hébergeant des mutations du gène POLE, elles ont un pronostic favorable et sont très sensibles à l'immunothérapie.

Mutation du gène POLE

Les mutations POLE comprennent à la fois des mutations somatiques et germinales, avec un taux de mutation somatique de 6 % à 10 % et un taux de mutation germinale de 0,25 % à 4 %. Les mutations germinales sont héréditaires. Les types de mutations du gène POLE comprennent les duplications, les délétions et les insertions de nucléotides, la majorité des mutations représentant l'aneuploïdie. Les tests de mutation du gène POLE incluent les mutations de points chauds ou les variantes pathogènes au sein du domaine exonucléase POLE. Le domaine exonucléase POLE englobe les exons 9 à 14, avec plus de 80 % des variants pathogènes apparaissant dans les exons 9 et 13. Actuellement, 11 variants pathogènes ont été identifiés dans le gène POLE, notamment P286R, V411L, S297F, S459F, A456P, F367S, L424I, M295R, P436R, M444K et D368Y. De nouveaux sites de mutation pathogènes possibles sont signalés les uns après les autres, et quelques études ont confirmé des mutations pathogènes en dehors du domaine des exonucléases, mais leurs effets pathogènes doivent être confirmés davantage.

Tests génétiques POLE

Actuellement, les principales méthodes de détection des mutations du gène POLE comprennent le séquençage Sanger et le séquençage à haut débit (NGS) de deuxième génération. Les avantages du séquençage Sanger sont son faible coût et sa grande précision. Il est très économique et efficace pour détecter les sites variantes connus et peut être utilisé comme référence en matière de détection. Cependant, sa plus grande limitation réside dans sa faible couverture et sa faible sensibilité, et il ne peut pas détecter les sites de variantes inconnues. La technologie NGS présente les avantages d’un débit élevé, d’une grande précision et d’informations riches. Cependant, le coût élevé et la longueur du cycle de détection limitent la promotion et l’application du NGS dans la pratique clinique. De plus, pour réduire les coûts de détection et améliorer la sensibilité de la détection, la séquence cible peut être hybridée et capturée ou enrichie en amplicons avant le séquençage ciblé. L'édition 2021 du « Consensus des experts chinois sur la détection moléculaire du cancer de l'endomètre » recommande le séquençage à haut débit des fragments cibles des exons 9 à 14 du gène POLE, en particulier les mutations pathogènes dans le domaine exonucléase du gène POLE, lorsque les conditions le permettent.

Typage moléculaire précis du cancer de l'endomètre Norme de référence

CB-Gene Bio a lancé une norme de typage moléculaire précise pour le cancer de l'endomètre afin de faciliter les tests génétiques POLE. N'hésitez pas à nous contacter. Certaines données sont présentées ci-dessous :

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