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Norme de référence STR autosomique
Arrière-plan
STR (Short Tandem Repeat) fait référence à un modèle spécial dans la séquence d'ADN, c'est-à-dire qu'une chaîne de courtes séquences de nucléotides est répétée. Puisque la séquence STR de chaque individu est unique, elle peut être utilisée comme marqueur génétique pour l’identification individuelle. La technologie de détection du typage STR est largement utilisée en médecine légale, en anthropologie, en biologie et dans d’autres domaines. Sa fonction principale est d'être utilisée pour l'identification individuelle, les tests de paternité et la recherche sur la susceptibilité génétique des maladies.
En termes d'identification individuelle, les tests STR sont largement utilisés dans le domaine de la médecine légale, comme les enquêtes criminelles, l'identification des personnes disparues et l'identification des restes d'une catastrophe. Dans le même temps, le test STR est également la méthode de référence en matière de test de paternité, et sa précision et sa fiabilité ont été largement reconnues.
Dans l'étude de la génétique des populations animales et végétales, l'analyse STR peut être utilisée pour étudier la diversité génétique, la consanguinité et la dérive génétique des populations animales et végétales.
À l’heure actuelle, l’application la plus largement utilisée du STR reste l’identification cellulaire. En 2011, l'American National Standards Institute a publié une norme spéciale d'identification STR des cellules, et la ChP (Pharmacopée de la République populaire de Chine) prescrit également des tests STR pour le contrôle qualité des lignées cellulaires. Le génotypage STR a été utilisé comme référence en matière d’identification cellulaire par des organisations faisant autorité telles que l’ICLAC et l’ATCC.
Définition d'une norme STR autosomique
Un échantillon d'ADN stable et fiable avec des résultats de typage précis connus pour tous les loci STR autosomiques. Il est généralement dérivé d’une lignée cellulaire rigoureusement authentifiée pour garantir une précision absolue du génotypage et une réplicabilité illimitée.
Les fonctions principales d’un standard STR autosomique sont :
*Contrôle qualité : les normes doivent être appliquées simultanément aux expériences de tests ADN. Si les résultats de l'étalon diffèrent des valeurs connues, cela indique un problème avec le processus expérimental (par exemple, extraction de l'ADN, amplification PCR, électrophorèse), et tous les résultats des tests pour cet échantillon ne sont pas fiables et doivent être répétés.
*Étalonnage de comparaison des données : il fournit une référence unifiée pour la comparaison des données ADN au sein et entre les laboratoires du monde entier, garantissant que « [GATA]8 » mesuré dans le laboratoire de Zhang San et « [GATA]8 » mesuré dans le laboratoire de Li Si sont identiques, permettant ainsi le partage et l'interopérabilité des données.
Principe de la méthode d’identification STR
L'identification STR utilise la technologie PCR (réaction en chaîne par polymérase) pour amplifier des sites STR spécifiques, puis sépare les fragments amplifiés de différentes longueurs par électrophorèse. Étant donné que différents individus ont un nombre différent de répétitions sur des sites STR spécifiques, les longueurs des fragments amplifiés générés sont également différentes. En comparant ces longueurs, les caractéristiques génétiques de l'individu peuvent être déterminées, puis une certaine méthode de calcul peut être utilisée pour obtenir les résultats du typage STR.
Scénarios d'application
La principale application des normes STR autosomiques et de leur technologie de détection concerne la médecine légale et les tests de paternité, suivis par d'autres domaines de la vérification de l'identité.
1.Identification médico-légale – Applications principales
*Comparaison d'échantillons biologiques sur place : l'ADN est extrait d'échantillons prélevés sur les lieux du crime, tels que le sang, le sperme, les cheveux et la salive, puis profilé STR. Cet ADN est ensuite comparé au profil STR du suspect. Un jumelage réussi fournit des preuves solides pour résoudre l’affaire.
*Identification des corps non identifiés : les profils STR des restes non identifiés sont saisis dans une base de données ADN et comparés à l'ADN de la famille de la personne disparue, permettant ainsi l'identification.
*Construction de bases de données : des pays du monde entier ont créé de vastes bases de données ADN criminelles (telles que le système CODIS aux États-Unis). Toutes les données sont basées sur un ensemble de loci STR autosomiques. Les normes garantissent l’exactitude du stockage et des comparaisons de ces données.
2.Test de paternité
Les allèles STR d’un enfant sont à moitié paternels et à moitié maternels. En comparant les profils STR de trois individus, la filiation biologique peut être confirmée ou infirmée avec une précision supérieure à 99,99 %. C’est actuellement la référence.
3.Autres champs d'identification
*Identification des victimes de catastrophes : lors de catastrophes majeures telles que les accidents d'avion, les tsunamis et les incendies, il est souvent difficile d'identifier les restes par leur apparence. Les tests ADN STR sont le moyen le plus fiable d’identifier les victimes. Des normes garantissent la fiabilité de ce processus.
*Authentification des lignées de cellules souches : dans la recherche scientifique, le profilage STR est fréquemment utilisé pour confirmer l'identité des lignées cellulaires et éviter toute contamination ou confusion. L'American Advanced Tissue Culture Collection (ATCC) fournit des profils STR pour les lignées cellulaires qu'elle vend.
*Diagnostic génétique préimplantatoire (DPI) en FIV : l'analyse STR est parfois utilisée pour dépister simultanément les embryons pour des maladies génétiques et confirmer la paternité (afin d'éviter une identification erronée des embryons).
