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Services de tests NIPT (NGS)

Définition et aperçu

Le test prénatal non invasif (NIPT) est une technologie révolutionnaire de dépistage prénatal. Il utilise la technologie de séquençage de nouvelle génération (NGS) pour séquencer et analyser en profondeur l'ADN acellulaire (cfDNA) dans le plasma maternel, fournissant ainsi une méthode de dépistage prénatal de haute précision pour évaluer le risque d'aneuploïdies chromosomiques courantes chez le fœtus.

Comparé aux techniques traditionnelles de diagnostic prénatal invasives (telles que l'amniocentèse et le prélèvement de villosités choriales), le NIPT ne nécessite que 10 ml de sang veineux maternel, évitant ainsi complètement les risques d'infection intra-utérine et de fausse couche associés à la procédure (avec un risque d'environ 0,5 à 1 %). Par conséquent, il est plus facilement accepté par les femmes enceintes et offre des avantages significatifs tels qu’être non invasif, sûr et sans risque de fausse couche. Il est devenu une option de dépistage prénatal de première intention largement utilisée dans le monde.
 

Principe de fonctionnement

La base scientifique du NIPT découle d’une découverte importante en 1997 : la présence d’ADN acellulaire dérivé du fœtus (cfDNA) dans le sang périphérique maternel. Cet ADN, principalement dérivé des trophoblastes placentaires, est éliminé du sang maternel quelques heures après l'accouchement. Le cfDNA est détectable après 5 semaines de gestation et augmente avec l’âge gestationnel. À 12 semaines de gestation, le cfDNA représente généralement plus de 10 % du cfDNA maternel total, répondant ainsi aux exigences des tests NIPT de haute précision.
 
La technologie repose principalement sur le séquençage génomique massivement parallèle (MGS).
 
Les principes de travail fondamentaux sont les suivants :

1. Extraction d'ADN et construction d'une bibliothèque : le plasma est isolé à partir d'échantillons de sang veineux maternel, à partir desquels l'ADNc total (contenant des fragments d'ADN acellulaires maternels et fœtaux) est extrait et une bibliothèque de séquençage est construite.

2. Séquençage à haut débit (NGS) : l'ADN extrait est séquencé de manière massive et parallèle à l'aide de la technologie NGS, générant des dizaines de millions de courtes lectures d'ADN. 
 
3. Analyse bioinformatique : Les séquences mesurées sont comparées au génome humain de référence pour localiser précisément le chromosome auquel appartient chaque séquence.

4. Algorithmes statistiques et évaluation des risques : des algorithmes bioinformatiques avancés sont utilisés pour calculer le pourcentage de lectures de séquence pour chaque chromosome. Chez un fœtus diploïde normal, le pourcentage de lectures pour chaque chromosome est relativement constant. Si le fœtus présente une anomalie chromosomique (telle que la trisomie 21 dans le syndrome de Down), le pourcentage de lectures de séquence correspondant à ce chromosome s'écartera considérablement du seuil normal. À l’aide d’algorithmes statistiques complexes (tels que le test Z-score), l’ordinateur peut déterminer s’il existe un écart de dosage pour ce chromosome et ainsi calculer le risque de maladie fœtale.
 
 

Flux de travail

Notre service de tests NIPT suit une procédure opérationnelle rigoureuse et standardisée pour garantir l’exactitude et la fiabilité des résultats.
  • Les professionnels fourniront au client une explication détaillée du contenu du test, des avantages, des limites et de la portée applicable, et le client signera un formulaire de consentement pleinement éclairé.
  • Après 12 semaines de gestation, 10 ml de sang périphérique seront prélevés sur la mère à l'aide d'un tube de prélèvement sanguin dédié. L'agent protecteur spécial contenu dans ce tube protège efficacement la stabilité du cfDNA. Les échantillons sont transportés vers un laboratoire d’essais certifié dans des conditions de chaîne du froid.
  • * Séparation du plasma et extraction de l'ADN : une double centrifugation dans une centrifugeuse à grande vitesse sépare les composants du plasma et en purifie l'ADNc total.

    * Construction et séquençage de bibliothèques : la réparation des extrémités et l'ajout d'adaptateurs sont effectués sur les fragments de cfDNA pour construire des bibliothèques adaptées au séquençage NGS, qui sont ensuite traitées sur un instrument de séquençage à haut débit.

    * Analyse des données et génération de rapports : notre pipeline d'analyse bioinformatique exclusif traite, aligne et calcule les données de séquençage massives pour générer des valeurs de risque de dose chromosomique. Des analystes génétiques expérimentés examinent à la fois la qualité des données (par exemple, la concentration d'ADN fœtal) et les résultats.

    * Émission du rapport et conseil génétique : dans les 5 à 7 jours ouvrables suivant la réception des échantillons qualifiés, le laboratoire publiera un rapport de test officiel clair et facile à comprendre indiquant clairement le niveau de risque (élevé ou faible) pour la maladie cible (par exemple, T21, T18, T13). Nos conseillers en génétique ou cliniciens partenaires interpréteront le rapport en fonction des résultats et fourniront des conseils de suivi professionnels et des services de consultation. Pour les résultats à haut risque, un diagnostic prénatal invasif est généralement recommandé pour un diagnostic définitif.

Avantages techniques

Ultra-haute précision

Le taux de détection de la trisomie 21 (syndrome de Down), de la trisomie 18 (syndrome d'Edwards) et de la trisomie 13 (syndrome de Patau) (> 99 %) est significativement plus élevé que le dépistage traditionnel du syndrome de Down (environ 70 à 90 %), tout en réduisant considérablement le taux de faux positifs à moins de 0,1 %.

Sécurité extrêmement élevée

Ne nécessitant qu'un prélèvement de sang veineux chez la mère, cette méthode évite les risques d'infection intra-utérine et de fausse couche (environ 0,5 à 1 %) associés au prélèvement de villosités choriales ou à l'amniocentèse, ce qui conduit à une forte acceptation chez les femmes enceintes.

Large couverture de détection

En plus de la trisomie trisomique autosomique, les services NIPT haut de gamme offrent également des options de dépistage des aneuploïdies des chromosomes sexuels (telles que le syndrome de Turner et le syndrome de Klinefelter) et de divers syndromes de microdélétion/microduplication chromosomique.

Tests gestationnels précoces

Les tests peuvent être effectués dès 10 semaines de gestation, fournissant des résultats rapides et suffisamment de temps pour une prise de décision ultérieure.

Des résultats clairs et fiables

Basés sur une analyse quantitative numérique utilisant NGS, les résultats sont objectifs, réduisant efficacement l’incertitude causée par les fluctuations des indicateurs sérologiques.

Haut débit et haut degré d'automatisation

La technologie NGS permet de tester simultanément un grand nombre d’échantillons, ce qui se traduit par une efficacité élevée.

Scénarios d'application et populations applicables

  Dépistage des aneuploïdies courantes : il s'agit de l'application principale du NIPT, principalement utilisée pour dépister la trisomie 21 (syndrome de Down), la trisomie 18 (syndrome d'Edwards) et la trisomie 13 (syndrome de Patau), avec des taux de précision supérieurs à 99 %.
  Dépistage des aneuploïdies des chromosomes sexuels : comme le syndrome de Turner (45, X) et le syndrome de Klinefelter (47, XXY).
  Détermination du sexe fœtal : En analysant la présence ou l'absence de séquences sur le chromosome Y, le sexe fœtal peut être déterminé précocement, ce qui est important pour l'évaluation du risque de maladies génétiques liées au sexe.
  Dépistage du syndrome de microdélétion/microduplication : certains produits NIPT améliorés peuvent dépister des maladies causées par de petites délétions ou duplications chromosomiques, telles que le syndrome de DiGeorge (délétion 22q11.2).
Le NIPT convient à toutes les femmes enceintes qui souhaitent exclure les risques chromosomiques courants pour le fœtus et est particulièrement recommandé pour les personnes suivantes :

*Femmes enceintes avancées (âge ≥ 35 ans à l'accouchement).
*Femmes enceintes dont les résultats du dépistage sérologique indiquent un risque élevé ou limite.
*Femmes enceintes présentant des marqueurs échographiques mous anormaux (tels qu'une augmentation du NT) qui ne souhaitent pas subir un diagnostic prénatal invasif.
*Femmes enceintes ayant des antécédents d'anomalies chromosomiques ou des antécédents familiaux d'un tel fœtus.
*Femmes enceintes ayant subi une FIV ou des fausses couches multiples. Les femmes enceintes d’âge gestationnel moyen qui exigent une plus grande précision et une plus grande tranquillité d’esprit en matière de dépistage prénatal.

Remarque importante : le NIPT est une technique de dépistage de haute précision et non un diagnostic définitif. Malgré sa grande précision, tout test de dépistage comporte un très faible risque de faux positifs et de faux négatifs. Par conséquent, les résultats NIPT à haut risque doivent être confirmés par des techniques de diagnostic prénatal invasives telles que l’amniocentèse.
La technologie NIPT basée sur NGS constitue une étape importante dans le dépistage prénatal. Il intègre avec succès la génomique à la médecine clinique, fournissant aux futurs parents des informations puissantes et sans précédent à partir d'un simple échantillon de sang, faisant ainsi progresser de manière significative la prévention et le traitement des malformations congénitales. Cependant, il est crucial de bien comprendre son rôle en tant que technique de « dépistage avancé ». Il devrait être intégré au conseil génétique professionnel en tant qu’élément clé des soins prénatals, aidant les familles à faire des choix éclairés en matière de procréation et à accueillir des nouveau-nés en bonne santé.
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