Étalon de référence Micro-Del/Micro-Dup

Que sont les microdélétions et les microduplications ?

Les microdélétions et les microduplications font référence à la suppression ou à la duplication de petits fragments sur les chromosomes. La taille de ces fragments est généralement comprise entre 1 Ko et plusieurs mégabases.

Que sont les standards de référence en matière de microdélétion/microduplication ?

Un étalon de référence de microdélétion/microduplication est un outil de contrôle qualité. Il s’agit d’un échantillon d’ADN connu, conçu avec précision et validé, contenant une microdélétion ou une microduplication spécifique et bien définie.

Ses principales fonctions et son importance résident dans :

1. Contrôle qualité (CQ) : lors de la réalisation de tests génétiques (tels que MLPA, CMA et NGS) en laboratoire, des normes de référence sont nécessaires pour vérifier l'exactitude et la fiabilité de l'ensemble du processus expérimental, depuis l'extraction et l'amplification de l'ADN jusqu'à la détection. Si l’étalon de référence produit les résultats attendus, cela indique que le processus expérimental est sans faille et que les résultats de l’échantillon du patient sont fiables.

2. Vérification et validation des résultats : lorsqu'une microdélétion/microduplication suspectée est détectée dans un échantillon de patient, l'étalon de référence correspondant peut être utilisé pour des tests et une confirmation simultanés. C'est comme utiliser une « règle standard » pour mesurer la longueur d'un objet afin de garantir des mesures précises.

Étalonnage des instruments et validation des performances : lorsqu'un nouvel équipement est utilisé ou qu'une nouvelle méthode de test est établie, des étalons de référence doivent être utilisés pour étalonner et valider la sensibilité et la spécificité de l'instrument et de la méthode.

À quelles maladies les normes de microdélétion et de microduplication sont-elles liées ?

Les syndromes de microdélétion/microduplication sont une cause importante de nombreuses maladies, particulièrement étroitement associées aux suivantes :

Anomalies congénitales du développement :Déficience intellectuelle et retard de développement、Trouble du spectre autistique (TSA)

、 Maladie cardiaque congénitale 、 Déformations faciales telles que fente labiale et palatine

Syndromes classiques spécifiques ：

Syndrome de délétion 22q11.2 (syndrome de DiGeorge) : syndrome le plus courant, caractérisé par des malformations cardiaques, une fente palatine, une immunosuppression, une hypocalcémie et des difficultés d'apprentissage.

Syndrome de Williams (délétion 7q11.23) : caractérisé par une apparence « elfique », une maladie cardiovasculaire, une personnalité sociable, une déficience intellectuelle et un talent musical exceptionnel.

Syndrome de Prader-Willi (délétion 15q11-q13) : hypotonie et difficultés d'alimentation pendant la petite enfance, suivies de l'obésité, d'une déficience intellectuelle et de problèmes de comportement pendant l'enfance.

Syndrome d'Angelman (délétion maternelle de 15q11-q13) : caractérisé par une déficience intellectuelle sévère, des troubles du langage, une ataxie et des rires/excitations fréquents. 

Syndrome de délétion 1p36 : les manifestations comprennent une déficience intellectuelle, un retard de croissance, l'épilepsie et des traits du visage distinctifs.

Syndrome du cri du chat (délétion 5p) : les nourrissons éprouvent un cri semblable à celui d'un chat, accompagné d'une déficience intellectuelle sévère et d'une microcéphalie.

Maladies oncologiques : De nombreux cancers sont associés à la délétion ou à l’amplification de gènes spécifiques, qui sont également considérés comme des variations du nombre de copies. Par exemple, l’amplification du gène HER2 est associée à des thérapies ciblées contre certains cancers du sein.

Quels sont les scénarios d’application ?

La technologie de détection de microdélétion/microduplication est principalement utilisée dans les scénarios cliniques et de recherche suivants :

1. Diagnostic prénatal :

Tests ADN prénatals non invasifs (NIPT Plus) : en prélevant du sang périphérique maternel, le fœtus peut être dépisté pour les aneuploïdies chromosomiques courantes (telles que le syndrome de Down) et certains syndromes de microdélétion courants.

2. Diagnostic de confirmation pour les grossesses à haut risque : Si le NIPT, l'échographie (avec anomalies structurelles) ou le dépistage sérologique indiquent un risque élevé, des cellules fœtales sont obtenues par amniocentèse ou prélèvement de villosités choriales pour analyse par micropuce chromosomique (CMA) afin de confirmer la présence de microdélétions/microduplications.

3. Diagnostic des maladies génétiques chez l'enfant et l'adulte :

Pour les enfants atteints d'une déficience intellectuelle inexpliquée, d'un retard de développement, d'autisme ou de malformations congénitales multiples, le CMA est généralement le test génétique préféré, détectant la cause dans environ 15 à 20 % des cas.

4. Enquête sur les causes d’infertilité et de fausse couche :

Tester les couples subissant des fausses couches ou des embryons à répétition pour identifier les anomalies chromosomiques (y compris les microdélétions/microduplications) qui peuvent avoir conduit à un arrêt du développement.

5. Génomique du cancer :

Examen de l'ADN du tissu tumoral chez les patients atteints de cancer pour identifier les changements dans le nombre de copies de gènes associés au développement, à la progression et à la thérapie ciblée du cancer. Ceci est utilisé pour la classification, le pronostic et l'orientation sur les médicaments (par exemple, test HER2).

6. Recherche scientifique :

Utilisé pour découvrir de nouveaux locus génétiques associés à une maladie et étudier la relation entre la fonction des gènes et la dose-réponse.