Estándar de referencia Micro-Del/Micro-Dup

¿Qué son las microdeleciones y las microduplicaciones?

Las microdeleciones y microduplicaciones se refieren a la eliminación o duplicación de pequeños fragmentos en los cromosomas. Estos fragmentos suelen tener un tamaño de entre 1 kb y varias megabases.

¿Qué son los estándares de referencia para microdeleción/microduplicación?

Un estándar de referencia para microdeleción/microduplicación es una herramienta de control de calidad. Es una muestra de ADN conocida, diseñada con precisión y validada que contiene una microdeleción o microduplicación específica y bien definida.

Sus principales funciones e importancia radican en:

1.Control de calidad (QC): al realizar pruebas genéticas (como MLPA, CMA y NGS) en el laboratorio, se requieren estándares de referencia para verificar la precisión y confiabilidad de todo el proceso experimental, desde la extracción y amplificación del ADN hasta la detección. Si el estándar de referencia produce los resultados esperados, indica que el proceso experimental es perfecto y que los resultados de la muestra del paciente son confiables.

2.Verificación y validación de resultados: cuando se encuentra una sospecha de microdeleción/microduplicación en una muestra de un paciente, se puede utilizar el estándar de referencia correspondiente para pruebas y confirmación simultáneas. Esto es como usar una 'regla estándar' para medir la longitud de un objeto y garantizar mediciones precisas.

Calibración de instrumentos y validación del rendimiento: cuando se pone en uso un nuevo equipo o se establece un nuevo método de prueba, se deben utilizar estándares de referencia para calibrar y validar la sensibilidad y especificidad del instrumento y el método.

¿Con qué enfermedades están relacionados los estándares de microdeleción y microduplicación?

Los síndromes de microdeleción/microduplicación son una causa importante de numerosas enfermedades, particularmente estrechamente asociadas con las siguientes:

Anomalías congénitas del desarrollo: discapacidad intelectual y retraso del desarrollo, trastorno del espectro autista (TEA)

、 Cardiopatía congénita 、 Deformidades faciales como labio y paladar hendido

Síndromes clásicos específicos :

Síndrome de deleción 22q11.2 (síndrome de DiGeorge): el síndrome más común, caracterizado por defectos cardíacos, paladar hendido, inmunosupresión, hipocalcemia y dificultades de aprendizaje.

Síndrome de Williams (deleción 7q11.23): caracterizado por una apariencia 'elfina', enfermedad cardiovascular, personalidad sociable, discapacidad intelectual y talento musical excepcional.

Síndrome de Prader-Willi (deleción 15q11-q13): hipotonía y dificultades de alimentación en la infancia, seguidas de obesidad, discapacidad intelectual y problemas de conducta en la infancia.

Síndrome de Angelman (deleción materna de 15q11-q13): caracterizado por discapacidad intelectual grave, deterioro del lenguaje, ataxia y risa/excitación frecuentes. 

Síndrome de deleción 1p36: las manifestaciones incluyen discapacidad intelectual, retraso del crecimiento, epilepsia y rasgos faciales distintivos.

Síndrome de Cri du chat (deleción 5p): los bebés experimentan un llanto felino, acompañado de discapacidad intelectual grave y microcefalia.

Enfermedades oncológicas: Muchos cánceres están asociados con la deleción o amplificación de genes específicos, que también se consideran variaciones en el número de copias. Por ejemplo, la amplificación del gen HER2 se asocia con terapias dirigidas para ciertos cánceres de mama.

¿Cuáles son los escenarios de aplicación?

La tecnología de detección de microdeleción/microduplicación se utiliza principalmente en los siguientes escenarios clínicos y de investigación:

1. Diagnóstico prenatal:

Prueba prenatal de ADN no invasiva (NIPT Plus): al extraer sangre periférica materna, se puede examinar al feto para detectar aneuploidías cromosómicas comunes (como el síndrome de Down) y algunos síndromes de microdeleción comunes.

2. Diagnóstico confirmatorio para embarazos de alto riesgo: si la NIPT, la ecografía (con anomalías estructurales) o el examen serológico indican un alto riesgo, las células fetales se obtienen mediante amniocentesis o muestreo de vellosidades coriónicas para el análisis de microarrays cromosómicos (CMA) para confirmar la presencia de microdeleciones/microduplicaciones.

3. Diagnóstico de enfermedades genéticas en niños y adultos:

Para los niños con discapacidad intelectual inexplicable, retraso en el desarrollo, autismo o múltiples malformaciones congénitas, la CMA suele ser la prueba genética preferida, ya que detecta la causa en aproximadamente el 15-20% de los casos.

4. Investigación de las causas de infertilidad y aborto espontáneo:

Realizar pruebas a parejas que experimentan abortos espontáneos recurrentes o embriones para identificar anomalías cromosómicas (incluidas microdeleciones/microduplicaciones) que pueden haber provocado una parada del desarrollo.

5. Genómica del cáncer:

Examinar el ADN del tejido tumoral en pacientes con cáncer para identificar cambios en el número de copias de genes asociados con el desarrollo, la progresión y la terapia dirigida del cáncer. Se utiliza para clasificación, pronóstico y orientación sobre la medicación (p. ej., prueba de HER2).

6. Investigación Científica:

Se utiliza para descubrir nuevos loci genéticos asociados a enfermedades y estudiar la relación entre la función genética y la dosis-respuesta.