La RT-PCR es esencialmente un proceso de reacción enzimática de dos etapas diseñado para el análisis cualitativo o cuantitativo de secuencias de ARN específicas presentes en cantidades mínimas.
Transcripción inversa (RT)
Traduciendo el 'Lenguaje del ARN' al 'Lenguaje del ADN'
El paso de transcripción inversa utiliza la transcriptasa inversa, que utiliza la muestra de ARN total como plantilla. Guiado por cebadores específicos (cebadores Oligo(dT) para anclar la cola poliA del ARNm, o hexámeros aleatorios para una captura completa), cataliza la síntesis de una cadena de ADN complementaria, conocida como ADN complementario (ADNc).
PCR cuantitativa en tiempo real (qPCR)
Amplificación exponencial y monitorización en tiempo real de las 'Instrucciones de ADN'
El ADNc sintetizado en la primera etapa se utiliza como plantilla. Se añaden cebadores específicos, una ADN polimerasa (p. ej., polimerasa Taq termoestable) y un sistema de notificación fluorescente (descrito a continuación) para realizar la amplificación por PCR cíclica. Cada ciclo consta de: desnaturalización, recocido y extensión.