Guiada por un ARN guía único (sgRNA), la endonucleasa Cas9 induce una rotura de doble hebra (DSB) en un locus genómico específico. Luego, la célula activa la vía de reparación mediada por recombinación homóloga. En presencia de una plantilla de ADN donante altamente homóloga, la secuencia donante se utiliza para reparar la rotura, lo que permite la inserción precisa del fragmento de ADN objetivo en el genoma en la ubicación deseada.
Detección de líneas celulares Knock-In : después de la transfección o transducción, se analizan las células para identificar aquellas con una integración genética exitosa. Por lo general, esto se logra utilizando marcadores seleccionables, como genes de resistencia a antibióticos, indicadores fluorescentes o ensayos de detección genética.