Services de tests TMB(WES)

La charge mutationnelle tumorale (TMB) fait référence au nombre total de mutations de gènes somatiques (y compris les mutations ponctuelles, les insertions/délétions, etc.) par million de paires de bases dans le génome d'une tumeur. Il quantifie le degré de mutation des cellules tumorales.

En termes simples, un TMB plus élevé indique un nombre plus élevé de protéines anormales (néoantigènes) produites par les cellules tumorales. Ces néoantigènes sont plus susceptibles d'être reconnus comme « étrangers » par le système immunitaire de l'organisme (cellules T), déclenchant ainsi une attaque immunitaire plus robuste. Lorsque des immunothérapies telles que les inhibiteurs PD-1/PD-L1 sont utilisées pour éliminer la suppression tumorale des cellules immunitaires, les patients atteints de tumeurs TMB élevées sont plus susceptibles d'obtenir des résultats thérapeutiques favorables et des réponses cliniques durables.

La technologie WES repose sur le séquençage à haut débit d’environ 20 000 exons codant pour des protéines dans le génome humain (environ 1 % du génome total). En comparant les séquences génétiques du tissu tumoral avec celles du tissu normal du patient (généralement du sang ou des tissus adjacents), les algorithmes bioinformatiques peuvent identifier avec précision les mutations somatiques qui se produisent uniquement dans les cellules tumorales.

La formule de calcul du TMB est la suivante :
TMB = (Nombre total de mutations somatiques détectées / Taille totale de la région d'exon couverte par le séquençage (Mb))
L'unité est mut/Mb (mutations par million de bases).

Par exemple, si un test WES couvrant 35 Mo de région d'exon identifie 350 mutations somatiques dans un échantillon, la valeur TMB est de 350/35 = 10 mut/Mb.

WES couvre l’intégralité de l’exome, dépassant la plage de détection de tout autre panel. Il capture de manière impartiale toutes les mutations de la région codante, reproduisant au maximum la véritable valeur du TMB et évitant les biais de calcul du TMB causés par les variations de conception du panel (par exemple, nombre variable de gènes ou taille).

Les données générées par un seul test WES constituent un atout précieux pour les patients. Avec les progrès de la recherche scientifique, de nouveaux biomarqueurs sont constamment découverts. Les données WES existantes peuvent être réanalysées à tout moment pour découvrir une nouvelle valeur clinique sans qu’il soit nécessaire de procéder à de nouveaux tests.

Les données complètes fournies par WES constituent un outil puissant pour découvrir de nouveaux gènes pathogènes, de nouvelles cibles médicamenteuses et de nouveaux antigènes, faisant ainsi progresser de manière significative à la fois la recherche fondamentale en oncologie et la médecine translationnelle.