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Estándar de referencia de tipificación molecular precisa del cáncer de endometrio

Vistas: 0 Autor: Editor del sitio Hora de publicación: 2024-04-11 Origen: Sitio

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En 2013, The Cancer Genome Atlas (TCGA) clasificó el cáncer de endometrio en cuatro subtipos basándose en análisis multiómicos, incluidos análisis de genoma completo, transcriptoma y proteoma: mutación POLE, mutación de inestabilidad de microsatélites, subtipo de número de copias bajo y subtipo de número de copias alto. Las recomendaciones de estadificación de la Federación Internacional de Ginecología y Obstetricia (FIGO) de 2023 dictan que todas las pacientes con cáncer de endometrio (CE) se sometan a pruebas de subtipo molecular.

El 29 de enero de 2024, la Red Nacional Integral del Cáncer (NCCN) actualizó sus directrices para el cáncer de colon y recto a la versión 2024.V1. En comparación con las pautas de la NCCN V6 de 2023, la versión V1 de 2024 agregó pruebas moleculares para mutaciones POLE y POLD1 y genes de fusión RET por primera vez.

Introducción al gen POLE

El gen POLE, situado en 12q24.33, consta de 63.762 pares de bases y abarca 51 exones. Codifica la subunidad catalítica de la ADN polimerasa Pol épsilon, que comprende un dominio catalítico y un dominio exonucleasa y es crucial para la corrección durante la replicación del ADN. Cuando se producen mutaciones patógenas en el dominio exonucleasa del gen POLE, lo que impide que la proteína realice oportunamente una corrección de errores durante la replicación del ADN, el genoma del tumor acumula numerosos errores de replicación durante la proliferación celular, lo que da como resultado una frecuencia de mutación entre 10 y 100 veces mayor que la de las células normales (normalmente <10 mutaciones/Mb). Una mutación POLE se diagnostica sólo cuando se detecta una mutación patogénica en el dominio de la exonucleasa (exones 9-14) en un tumor. Las mutaciones del gen polar pueden conducir a la tumorigénesis.

Los estudios actuales han demostrado que, a pesar de la morfología altamente maligna de los tumores que albergan mutaciones en el gen POLE, tienen un pronóstico favorable y responden muy bien a la inmunoterapia.

Mutación del gen POLE

Las mutaciones POLE incluyen mutaciones tanto somáticas como germinales, con una tasa de mutación somática del 6% al 10% y una tasa de mutación de la línea germinal del 0,25% al 4%. Las mutaciones de la línea germinal son hereditarias. Los tipos de mutaciones del gen POLE incluyen duplicaciones, eliminaciones e inserciones de nucleótidos, y la mayoría de las mutaciones representan aneuploidía. Las pruebas de mutación del gen POLE incluyen mutaciones puntuales o variantes patogénicas dentro del dominio de exonucleasa POLE. El dominio de exonucleasa POLE abarca los exones 9-14, y más del 80 % de las variantes patogénicas se producen en los exones 9 y 13. Actualmente, se han identificado 11 variantes patogénicas dentro del gen POLE, incluidas P286R, V411L, S297F, S459F, A456P, F367S, L424I, M295R, P436R, M444K y D368Y. Se están informando uno tras otro de nuevos posibles sitios de mutación patógena, y algunos estudios han confirmado mutaciones patógenas fuera del dominio de la exonucleasa, pero sus efectos patógenos necesitan mayor confirmación.

Prueba del gen POLE

Actualmente, los principales métodos para detectar mutaciones del gen POLE incluyen la secuenciación de Sanger y la secuenciación de alto rendimiento (NGS) de segunda generación. Las ventajas de la secuenciación Sanger son su bajo costo y su alta precisión. Es muy económico y eficiente para detectar sitios variantes conocidos y puede usarse como estándar de oro para la detección. Sin embargo, su mayor limitación es su baja cobertura y sensibilidad, y no puede detectar sitios de variantes desconocidas. La tecnología NGS tiene las ventajas de un alto rendimiento, alta precisión e información rica. Sin embargo, el alto costo y el largo ciclo de detección limitan la promoción y aplicación de NGS en la práctica clínica. Además, para reducir los costos de detección y mejorar la sensibilidad de la detección, la secuencia objetivo se puede hibridar y capturar o enriquecer con amplicones antes de la secuenciación objetivo. La edición de 2021 del 'Consenso de expertos chinos sobre la detección molecular del cáncer de endometrio' recomienda la secuenciación de fragmentos objetivo de alto rendimiento de los exones 9 a 14 del gen POLE, especialmente las mutaciones patógenas en el dominio exonucleasa del gen POLE, cuando las condiciones lo permitan.

Estándar de referencia de tipificación molecular precisa del cáncer de endometrio

CB-Gene Bio ha lanzado un estándar de tipificación molecular preciso para el cáncer de endometrio para ayudar en las pruebas del gen POLE. No dude en contactarnos. Algunos datos se muestran a continuación:

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