Contrôle du cocktail de fusion d'ARN Panel-Ref®

Présentation du produit

Les fusions de gènes (par exemple EML4-ALK, BCR-ABL1) sont à l'origine de cancers malins du sang et de tumeurs solides, ce qui en fait des biomarqueurs essentiels pour une thérapie ciblée. Le Panel-Ref® RNA-Fusion Cocktail Control (CBP90001) est un matériau de contrôle qualité de haute qualité mis à niveau en 2021 pour inclure 22 sites de fusion (au lieu de 11) et un format de lame FFPE (remplaçant la solution d'ARN) pour mieux simuler le traitement des échantillons cliniques (par exemple, extraction d'ARN). Il contient 11 transcriptions de fusion cliniquement pertinentes, toutes quantifiées via ddPCR pour plus de précision.

Avantages principaux

Simulation d'échantillons cliniques au format FFPE

Le format de diapositive FFPE reproduit les flux de travail cliniques réels (par exemple, fixation de formol, extraction d'ARN), aidant les laboratoires à valider les performances des tests à chaque étape, contrairement aux normes d'ARN liquide.

Couverture complète de fusion

Comprenant 11 fusions à fort impact (par exemple, les fusions NTRK, RET, ROS1), il prend en charge la validation des tests de détection de fusion basés sur NGS/ddPCR pour les cancers du poumon, du sein et hématologiques.

Précision qualifiée ddPCR

Le numéro de copie de chaque fusion est calibré via ddPCR, garantissant une quantification précise pour tester la sensibilité du test (par exemple, détection des transcriptions de fusion en faible abondance) et la reproductibilité.

Sans RNase et résistant à la dégradation

Conditionné dans un tampon sans RNase avec une valeur RNQ élevée, il maintient l’intégrité de l’ARN pendant le stockage et la manipulation, évitant ainsi les faux négatifs provenant d’échantillons dégradés.

Processus de service

Consultation de précommande

Nous vous conseillons sur la sélection de la fusion (par exemple, donner la priorité à EML4-ALK pour la recherche sur le cancer du poumon) et sur le format (solution d'ARN ou FFPE) en fonction de votre plateforme de test (par exemple, RNA-seq, RT-ddPCR).

Expédition sécurisée et à température contrôlée

L'ARN est expédié sur de la neige carbonique pour préserver son intégrité ; Les lames FFPE incluent des instructions de manipulation pour empêcher la dégradation de l’ARN pendant le traitement.

Conseils techniques pour l’extraction et les tests

Notre équipe fournit des protocoles pour l'extraction d'ARN FFPE, la transcription inverse et la détection de fusion, aidant à résoudre des problèmes tels qu'un faible rendement ou des résultats incohérents.

Prise en charge de la vérification du numéro de copie

Nous partageons les données d'étalonnage ddPCR pour vous aider à vérifier de manière croisée l'exactitude de la quantification de votre test pour chaque transcription de fusion.

Pourquoi choisir ce contrôle de fusion d'ARN ?

La détection de la fusion génétique nécessite un contrôle qualité robuste pour éviter un diagnostic erroné des patients. Le format FFPE de cette norme, la validation ddPCR et la couverture complète de fusion la rendent idéale pour optimiser les flux de travail RNA-seq/ddPCR, surveiller les performances quotidiennes des tests et garantir une détection fiable des biomarqueurs. Contactez-nous pour rationaliser votre contrôle qualité des tests de fusion.

Il existe trois mécanismes principaux de fusion génétique, comme le montre la figure suivante :

Il existe trois mécanismes courants de fusion génétique :

1) Translocation chromosomique. Comme le montre la figure A ci-dessus, les deux segments des chromosomes 1 et 2 se croisent et s'échangent, entraînant la fusion du gène vert clair sur le chromosome 1 et du gène orange sur le chromosome 2 ;

2) Suppression interstitielle. Comme le montre la figure ci-dessus, le segment entre le gène orange et le gène vert clair sur le chromosome 3 est supprimé, entraînant finalement la fusion des deux gènes ;

3) Inversion chromosomique. Par exemple, le segment entre le gène orange et le gène vert foncé sur le chromosome 4 est inversé, ce qui aboutit finalement à la fusion du gène orange et du gène vert clair.

informations générales

Nom	Contrôle du cocktail de fusion d'ARN Panel-Ref®
Chat. Non.	CBP90001
Format	ARN
Tampon	H2O sans RNase
Conc.(Qubit3.0)	60ng/ul
OD260/OD280 (1,8 ~ 2,1)	1.98
Valeur RNQ (>9 (Qsep)	>9
Numéro de copie (DdPCR)	Ci-dessous
Description	ARN contenant 11 mutations de fusion, toutes quantifiées par dPCR
Taille	1ug
Utilisation prévue	Utilisation pour la recherche uniquement
Conditions de stockage	-90 ℃ ~ 70 ℃
Expiration	12 mois à compter de la date de fabrication

Données détaillées

Nom	Gène gauche	Point d'arrêt gauche	Bon gène	Point d'arrêt droit	Copies/ng
Fusion CCDC6-RET (E1-E12)	CCDC6(E1)	chr10:61665880:-	RET(E12)	chr10:43612032:+	Téléchargement du COA
Fusion EML4-ALK (E13-E20)	EML4(E13)	chr2:42522656:+	ALK(A20)	chr2:29446394:-	Téléchargement du COA
Fusion ETV6-NTRK3 (E5-E15)	ETV6(E5)	chr12:12022903:+	NTRK3(E15)	chr15:88483984:-	Téléchargement du COA
Fusion KIF5B-RET (E15-E12)	KIF5B(E15)	chr10:32317356:-	RET(E12)	chr10:43612032:+	Téléchargement du COA
Fusion NPM1-ALK (E4-E20)	MNP1(E4)	chr5:170818803:+	ALK(E20)	chr2:29446394:-	Téléchargement du COA
Fusion SLC34A2-ROS1 (E4-E32)	SLC34A2(E4)	chr4:25665952:+	ROS1(E32)	chr6:117650609:-	Téléchargement du COA
Fusion TPM3-NTRK1 (E7-E9)	TPM3(E7)	chr1:154142876:-	NTRK1(E9)	chr1:156844363:+	Téléchargement du COA
FGFR3-TACC3 (E17-E11)	FGFR3(E17)	chr4:1808661:+	TACC3(E11)	chr4:1741429:+	Téléchargement du COA
MET exon14 Sauter (E13-E15)	RENCONTRÉ(E13)	chr7:116411708:+	RENCONTRÉ(E15)	chr7:116414935:+	Téléchargement du COA
BCR-ABL1 (E14-E2)	RCO(E14)	chr22:23632600:+	ABL1(E2)	chr9:133729451:+	Téléchargement du COA
CD74-ROS1(E6-E34)	CD74(E6)	chr5:149784243:-	ROS1(E34)	chr6:117645578:-	Téléchargement du COA