Control de cóctel de fusión de ARN Panel-Ref®

Descripción general del producto

Las fusiones de genes (p. ej., EML4-ALK, BCR-ABL1) provocan cánceres sanguíneos malignos y tumores sólidos, lo que los convierte en biomarcadores fundamentales para la terapia dirigida. El control de cóctel Panel-Ref® RNA-Fusion (CBP90001) es un material de control de calidad de alta calidad actualizado en 2021 para incluir 22 sitios de fusión (de 11) y formato de portaobjetos FFPE (que reemplaza la solución de ARN) para simular mejor el procesamiento de muestras clínicas (p. ej., extracción de ARN). Contiene 11 transcripciones de fusión clínicamente relevantes, todas cuantificadas mediante ddPCR para mayor precisión.

Ventajas principales

Simulación de muestras clínicas con formato FFPE

El formato de portaobjetos FFPE replica los flujos de trabajo clínicos del mundo real (p. ej., fijación con formalina, extracción de ARN), lo que ayuda a los laboratorios a validar el rendimiento del ensayo en cada paso, a diferencia de los estándares de ARN líquido.

Cobertura integral de fusión

Al incluir 11 fusiones de alto impacto (p. ej., fusiones NTRK, RET, ROS1), respalda la validación de ensayos de detección de fusiones basados ​​en NGS/ddPCR para cánceres de pulmón, mama y hematológicos.

Precisión calificada por ddPCR

El número de copias de cada fusión se calibra mediante ddPCR, lo que garantiza una cuantificación precisa para probar la sensibilidad del ensayo (p. ej., detectar transcripciones de fusión de baja abundancia) y la reproducibilidad.

Sin ARNasa y resistente a la degradación

Empaquetado en tampón libre de RNasa con alto valor RNQ, mantiene la integridad del ARN durante el almacenamiento y manipulación, evitando falsos negativos de muestras degradadas.

Proceso de servicio

Consulta de reserva

Le asesoramos sobre la selección de la fusión (p. ej., priorizar EML4-ALK para la investigación del cáncer de pulmón) y el formato (solución de ARN versus FFPE) según su plataforma de ensayo (p. ej., RNA-seq, RT-ddPCR).

Envío seguro y con temperatura controlada

El ARN se envía en hielo seco para preservar la integridad; Los portaobjetos FFPE incluyen instrucciones de manipulación para evitar la degradación del ARN durante el procesamiento.

Orientación técnica para extracción y pruebas

Nuestro equipo proporciona protocolos para la extracción de ARN FFPE, la transcripción inversa y la detección de fusiones, lo que ayuda a resolver problemas como el bajo rendimiento o los resultados inconsistentes.

Soporte de verificación de número de copia

Compartimos datos de calibración de ddPCR para ayudarlo a realizar una verificación cruzada de la precisión de cuantificación de su ensayo para cada transcripción de fusión.

¿Por qué elegir este control de fusión de ARN?

La detección de fusiones genéticas requiere un control de calidad sólido para evitar diagnósticos erróneos de los pacientes. El formato FFPE de este estándar, la validación de ddPCR y la cobertura de fusión integral lo hacen ideal para optimizar los flujos de trabajo de RNA-seq/ddPCR, monitorear el rendimiento de las pruebas diarias y garantizar una detección confiable de biomarcadores. Contáctenos para optimizar el control de calidad de sus pruebas de fusión.

Existen tres mecanismos principales para la fusión de genes, como se muestra en la siguiente figura:

Hay tres mecanismos comunes de fusión genética:

1) Translocación cromosómica. Como se muestra en la Figura A anterior, los dos segmentos de los cromosomas 1 y 2 se cruzan y se intercambian, lo que da como resultado la fusión del gen verde claro en el cromosoma 1 y el gen naranja en el cromosoma 2;

2) Eliminación intersticial. Como se muestra en la figura anterior, el segmento entre el gen naranja y el gen verde claro en el cromosoma 3 se elimina, lo que eventualmente resulta en la fusión de los dos genes;

3) Inversión cromosómica. Por ejemplo, el segmento entre el gen naranja y el gen verde oscuro en el cromosoma 4 se invierte, lo que eventualmente resulta en la fusión del gen naranja y el gen verde claro.

información general

Nombre	Control de cóctel Panel-Ref® RNA-Fusion
Gato. No.	CBP90001
Formato	ARN
Buffer	H2O libre de ARNasa
Conc.(Qubit3.0)	60ng/uL
OD260/OD280(1,8~2,1)	1.98
Valor RNQ(>9 (Qsep)	>9
Número de copia (DdPCR)	Abajo
Descripción	ARN que contiene 11 mutaciones de fusión, todas cuantificadas por dPCR
Tamaño	1ug
Uso previsto	Sólo para uso en investigación
Condiciones de almacenamiento	-90 ℃ ~ 70 ℃
Expiración	12 meses desde la fecha de fabricación

Datos detallados

Nombre	gen izquierdo	Punto de interrupción izquierdo	Gen derecho	Punto de interrupción derecho	Copias/ng
Fusión CCDC6-RET (E1-E12)	CCDC6(E1)	chr10:61665880:-	RETIRAR(E12)	cr10:43612032:+	descargar COA
Fusión EML4-ALK (E13-E20)	EML4(E13)	cro2:42522656:+	ALK(A20)	chr2:29446394:-	descargar COA
Fusión ETV6-NTRK3 (E5-E15)	ETV6(E5)	cr12:12022903:+	NTRK3(E15)	chr15:88483984:-	descargar COA
Fusión KIF5B-RET (E15-E12)	KIF5B(E15)	chr10:32317356:-	RETIRAR(E12)	cr10:43612032:+	descargar COA
Fusión NPM1-ALK (E4-E20)	NPM1(E4)	chr5:170818803:+	ALK(E20)	chr2:29446394:-	descargar COA
Fusión SLC34A2-ROS1 (E4-E32)	SLC34A2(E4)	cr4:25665952:+	ROS1(E32)	chr6:117650609:-	descargar COA
Fusión TPM3-NTRK1 (E7-E9)	TPM3(E7)	chr1:154142876:-	NTRK1(E9)	chr1:156844363:+	descargar COA
FGFR3-TACC3 (E17-E11)	FGFR3(E17)	cr4:1808661:+	TACC3(E11)	cr4:1741429:+	descargar COA
MET exon14 saltando (E13-E15)	CUMPLIDO(E13)	chr7:116411708:+	CUMPLIDO(E15)	chr7:116414935:+	descargar COA
BCR-ABL1 (E14-E2)	BCR(E14)	chr22:23632600:+	ABL1(E2)	chr9:133729451:+	descargar COA
CD74-ROS1(E6-E34)	CD74(E6)	chr5:149784243:-	ROS1(E34)	chr6:117645578:-	descargar COA