KRAS 5 % FFPE Bloc tumeur standard

Présentation du produit

Cet étalon de référence comprend des blocs de tissus tumoraux fixés au formol et inclus en paraffine (FFPE) avec une fréquence d'allèle mutant KRAS de 5 % calibrée avec précision , imitant l'hétérogénéité génétique des échantillons cliniques de patients. Fabriqué à l'aide d'un protocole exclusif de fixation douce et d'un processus d'incorporation de paraffine homogène, le produit élimine la variabilité associée aux matériaux dérivés du patient, offrant ainsi des performances constantes sur plusieurs analyses. Chaque bloc contient environ 2 x 10 ⁷ cellules (le nombre de cellules est principalement personnalisé en fonction des besoins du client) , garantissant suffisamment de matériel pour plusieurs extractions et validations de tests, ce qui le rend idéal pour les laboratoires cliniques, les développeurs de tests et les instituts de recherche axés sur le diagnostic oncologique.

Caractéristiques du produit

Authenticité génomique

La norme présente génétiquement vérifiées des mutations KRAS (y compris des variantes courantes telles que G12D, G12V et G13D) avec des fréquences alléliques quantifiées par PCR numérique en gouttelettes (ddPCR), garantissant une précision de ± 30 % de la valeur nominale de 5 %. Ce niveau de précision permet une évaluation fiable de la sensibilité du test pour la détection de mutations basse fréquence.

Intégrité de la matrice FFPE

Traités à l’aide d’une fixation de 4 % de PFA et de techniques d’intégration optimisées, les blocs FFPE maintiennent une intégrité histologique comparable à celle des échantillons cliniques. Cela préserve l'ADN de haut poids moléculaire (> 20 Ko) qui produit ≥ 400 ng par section en utilisant des protocoles d'extraction standard comme le système Promega Maxwell RSC Plus, facilitant ainsi la compatibilité avec les analyses moléculaires en aval.

Conformité de fabrication

Produit dans une installation certifiée ISO 13485:2016, chaque lot est soumis à un contrôle de qualité rigoureux, notamment une électrophorèse sur gel d'agarose pour l'intégrité de l'ADN et une quantification Quantifluor™ pour la précision de la concentration. Des certificats d'analyse complets (CoA) documentent la confirmation du génotype, la fréquence allélique et les mesures de pureté.

Usage

Préparation des échantillons

Sectionnez le bloc FFPE à une épaisseur de 5 à 10 μm en utilisant des techniques de microtomie standard. Pour des résultats optimaux, collectez 3 à 5 sections consécutives par extraction pour garantir un rendement d’ADN suffisant. Déparaffinez à l’aide de xylène ou de réactifs de déparaffinage commerciaux suivis d’une réhydratation à l’éthanol avant l’extraction de l’ADN.

Validation des tests

La norme prend en charge plusieurs plates-formes moléculaires, notamment les tests de panel NGS , le séquençage Sanger, la qPCR et la ddPCR. Il est particulièrement précieux pour :

• Établir une limite de détection (LOD) pour les mutations KRAS

• Vérification de l'intégrité du flux de travail, de l'extraction de l'ADN à l'analyse bioinformatique.

• Surveillance de la variabilité inter-essai et intra-essai

• Optimisation de nouveaux panels de détection du cancer

Stockage et manutention

Conservez les blocs non ouverts entre -25 °C et -15 °C pendant 36 mois maximum à compter de la date de fabrication. Une fois sectionnés, les blocs restants doivent être enveloppés dans un film de paraffine pour éviter le dessèchement. Évitez les cycles répétés de congélation et de décongélation, car ils pourraient compromettre l'intégrité de l'ADN.

FAQ

Quelles mutations sont présentes dans le bloc KRAS 5 % FFPE ?

La norme contient des mutations KRAS cliniquement pertinentes, notamment G12D, G12V, G13D et Q61H. Les mutations exactes sont spécifiées dans le CoA du produit.

Cette norme est-elle adaptée à la validation des bibliothèques NGS ?

Oui, la norme est entièrement compatible avec les flux de travail NGS. Son ADN de haute qualité prend en charge la préparation de bibliothèques pour les panels ciblés et le séquençage de l'exome entier, avec des performances vérifiées sur les plateformes Illumina, Ion Torrent et PacBio.

En quoi ce produit diffère-t-il des échantillons FFPE prélevés sur des patients ?

Contrairement aux échantillons de patients, qui présentent une variabilité imprévisible de la qualité de la fixation et de la composition cellulaire, cet étalon offre une fréquence d'allèles mutants et une intégrité de l'ADN cohérentes, permettant un étalonnage et un contrôle qualité fiables des tests.

Quelle est la méthode d’extraction recommandée ?

Bien que compatibles avec la plupart des kits d'extraction d'ADN FFPE commerciaux, nous recommandons des protocoles de colonne de centrifugation à base de silice ou des systèmes automatisés comme le Promega Maxwell RSC Plus pour un rendement et une pureté optimaux. Les extractions typiques donnent ≥400 ng d’ADN par section.

Numéro de cat.	Nom	Format	Épaisseur du bloc de cire	Numéro de cellule	Utilisation prévue	Stockage	Expiration
CBPS0001FB-5%	Bloc FFPE de l'étalon de référence KRAS p.G13D 5 %	Bloc FFPE	4mm	1,5*10^8	Utilisation pour la recherche uniquement	-25 ℃ ~ -15 ℃	36 mois
CBPS0002FB-5%	Bloc FFPE de l'étalon de référence KRAS p.G12A 5 %	Bloc FFPE	4mm	1,5*10^8	Utilisation pour la recherche uniquement	-25 ℃ ~ -15 ℃	36 mois
CBPS0003FB-5%	Bloc FFPE de l'étalon de référence KRAS p.G12C 5 %	Bloc FFPE	4mm	1,5*10^8	Utilisation pour la recherche uniquement	-25 ℃ ~ -15 ℃	36 mois
CBPS0004FB-5%	Bloc FFPE de l'étalon de référence KRAS p.A146T 5 %1	Bloc FFPE	4mm	1,5*10^8	Utilisation pour la recherche uniquement	-25 ℃ ~ -15 ℃	36 mois
CBPS0005FB-5%	Bloc FFPE de l'étalon de référence KRAS p.G12R 5 %	Bloc FFPE	4mm	1,5*10^8	Utilisation pour la recherche uniquement	-25 ℃ ~ -15 ℃	36 mois
CBPS0006FB-5%	Bloc FFPE de l'étalon de référence KRAS p.G12D 5 %	Bloc FFPE	4mm	1,5*10^8	Utilisation pour la recherche uniquement	-25 ℃ ~ -15 ℃	36 mois
CBPS0007FB-5%	Bloc FFPE de l'étalon de référence KRAS p.G12V 5%	Bloc FFPE	4mm	1,5*10^8	Utilisation pour la recherche uniquement	-25 ℃ ~ -15 ℃	36 mois
CBPS0008FB-5%	Bloc FFPE de l'étalon de référence KRAS p.G12S 5 %	Bloc FFPE	4mm	1,5*10^8	Utilisation pour la recherche uniquement	-25 ℃ ~ -15 ℃	36 mois
CBPS0009FB-5%	Bloc FFPE de l'étalon de référence KRAS p.Q61H 5 %	Bloc FFPE	4mm	1,5*10^8	Utilisation pour la recherche uniquement	-25 ℃ ~ -15 ℃	36 mois

Données techniques

Numéro de cat.	Nom	Changement d'ADN	Changement AA	Zygosité	Fréquence allélique	Transcription	ID cosmique	Position Chr(GRCh37)
CBPS0001FB-5%	Bloc FFPE de l'étalon de référence KRAS p.G13D 5 %1	c.38G>A	p.G13D	Hétérozygote	5%	ENST00000311936	COSM532	ch12:25398281
CBPS0002FB-5%	Bloc FFPE de l'étalon de référence KRAS p.G12A 5 %	c.35G>C	p.G12A	Hétérozygote	5%	ENST00000311936	COSM522	ch12:25398284
CBPS0003FB-5%	Bloc FFPE de l'étalon de référence KRAS p.G12C 5 %	c.34G>T	p.G12C	Hétérozygote	5%	ENST00000311936	COSM516	chr12:25398285
CBPS0004FB-5%	Bloc FFPE de KRAS p.A146T 5% 5% Étalon de référence	c.436G>A	p.A146T	Hétérozygote	5%	NM_033360.4	COSM19404	chr12:25378562
CBPS0005FB-5%	Bloc FFPE de l'étalon de référence KRAS p.G12R 5 %	c.34G>C	p.G12R	Hétérozygote	5%	ENST00000311936	COSM518	chr12:25398285
CBPS0006FB-5%	Bloc FFPE de l'étalon de référence KRAS p.G12D 5 %	environ 35G>A	p.G12D	Hétérozygote	5%	ENST00000311936	COSM521	ch12:25398284
CBPS0007FB-5%	Bloc FFPE de l'étalon de référence KRAS p.G12V 5%	environ 35G>T	p.G12V	Hétérozygote	5%	ENST00000311936	COSM520	ch12:25398284
CBPS0008FB-5%	Bloc FFPE de l'étalon de référence KRAS p.G12S 5 %	c.34G>A	p.G12S	Hétérozygote	5%	ENST00000311936	COSM517	chr12:25398285
CBPS0009FB-5%	Bloc FFPE de l'étalon de référence KRAS p.Q61H 5 %	c.183A>T	p.Q61H	Hétérozygote	5%	ENST00000311936	COSM555	ch12:25380275