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CBPE0206
CBPE0206
| Disponibilité: | |
|---|---|
Description du produit
Ce paquet contient plusieurs échantillons de détection du cancer du foie. Nous utilisons des lignées cellulaires cliniques simulées pour les préparer. Si vous testez SHOX2/PTGER4/RASSF1A, vous pouvez choisir ce produit.
Les altérations épigénétiques, en particulier l’hyperméthylation aberrante des régions promotrices de l’ADN, constituent un mécanisme clé dans le développement et la progression du cancer du poumon. Ils peuvent faire taire les gènes suppresseurs de tumeurs associés et favoriser la prolifération tumorale.
SHOX2 (Short Stature Homeobox 2) : La fonction de ce gène est liée au développement. Dans le cancer du poumon, sa région promotrice subit une hyperméthylation fréquente et spécifique. Cette méthylation aberrante est un marqueur moléculaire très fiable du cancer du poumon, le détectant efficacement dans divers tissus cancéreux du poumon et fluides du patient (tels que le sang, les crachats et le liquide de lavage broncho-alvéolaire) avec une sensibilité extrêmement élevée.
PTGER4 (Prostaglandin E Receptor 4) : De même, sa région promotrice présente une hyperméthylation significative dans les cellules cancéreuses du poumon. Cette altération épigénétique est associée à la répression transcriptionnelle des gènes et est considérée comme un événement précoce dans le développement du cancer du poumon, ce qui en fait un excellent marqueur diagnostique.
RASSF1A (membre 1A de la famille du domaine d'association Ras) : Il s'agit d'un gène suppresseur de tumeur classique. L’hyperméthylation de son promoteur fait taire directement le gène, lui faisant perdre ses fonctions d’inhibition de la croissance cellulaire et de promotion de l’apoptose, entraînant ainsi la progression tumorale. La méthylation de RASSF1A est l’une des anomalies épigénétiques les plus courantes dans le cancer humain et est fortement détectée dans le cancer du poumon.
Dans les tests de méthylation du cancer du poumon basés sur des biopsies liquides (comme le sang et le liquide de lavage broncho-alvéolaire), ils sont utilisés comme contrôle de qualité intrinsèque du système de détection.
informations générales
Nom |
Package-Ref™ Cancer du poumon SHOX2/PTGER4/RASSF1A pour le contrôle de la méthylation |
Chat. Non. |
CBPE0206 |
Format |
ADN génomique |
Taille |
1ug |
Tampon |
Tris-EDTA |
Utilisation prévue |
Utilisation pour la recherche uniquement |
Concentration |
Télécharger pour le COA |
Pureté |
Télécharger pour le COA |
Électrophorèse de l'ADN |
Télécharger pour le COA |
Conditions de stockage |
2 ~ 8 ℃ |
Expiration |
36 mois à compter de la date de fabrication |
Remarque |
Les données contenues dans le manuel d'instructions sont les données d'un seul test, et les données spécifiques de chaque lot sont soumises à la livraison. |
Données techniques
Classification |
Chat n° |
Nom |
Description |
Région |
Niveau de méthylation |
|
norme de contrôle de qualité |
CBPE0206-1 |
Cancer du poumon-SHOX2, PTGER4, RASSF1A positive Méthylation |
SHOX2 Méthylation positif Contrôle |
chr3:157821337-157821430(hg19) |
97,43% |
|
de méthylation PTGER4 positif Contrôle |
chr5:40681482-40681593(hg19) |
99,76% |
||||
de méthylation PTGER4 positif Contrôle |
chr5:40681898-40682110(hg19) |
96,26% |
||||
RASSF1A Méthylation positif Contrôle |
chr3:50378322-50378233(hg19) |
99,33% |
||||
CBPE0206-2 |
Cancer du poumon-SHOX2, PTGER4, RASSF1A négative Méthylation |
SHOX2 Méthylation négatif Contrôle |
chr3:157821337-157821430(hg19) |
0,00% |
||
PTGER4 Méthylation négatif Contrôle |
chr5:40681482-40681593(hg19) |
0,19% |
||||
PTGER4 Méthylation négatif Contrôle |
chr5:40681898-40682110(hg19) |
0,05% |
||||
RASSF1A Méthylation négatif Contrôle |
chr3:50378322-50378233(hg19) |
0,02% |
||||
CBPE0206-3 |
Cancer du poumon-PTGER4 hautement positive Référence de méthylation ，SHOX2 Méthylation négative , RASSF1A négative Méthylation |
SHOX2 Méthylation négatif Contrôle |
chr3:157821337-157821430(hg19) |
0,12% |
||
de méthylation PTGER4 positif Contrôle |
chr5:40681482-40681593(hg19) |
79,25% |
||||
de méthylation PTGER4 positif Contrôle |
chr5:40681898-40682110(hg19) |
84,78% |
||||
RASSF1A Méthylation négatif Contrôle |
chr3:50378322-50378233(hg19) |
0,00% |
||||
CBPE0206-4 |
Cancer du poumon-SHOX2, PTGER4 négative Méthylation ，RASSF1A positive Méthylation |
SHOX2 Méthylation négatif Contrôle |
chr3:157821337-157821430(hg19) |
0,12% |
||
PTGER4 Méthylation négatif Contrôle |
chr5:40681482-40681593(hg19) |
0,54% |
||||
PTGER4 Méthylation négatif Contrôle |
chr5:40681898-40682110(hg19) |
0,00% |
||||
RASSF1A Méthylation positif Contrôle |
chr3:50378322-50378233(hg19) |
81,66% |
||||
CBPE0206-5 |
Cancer du poumon-RASSF1A, PTGER4 négative Méthylation ，SHOX2 positive Méthylation |
SHOX2 Méthylation positif Contrôle |
chr3:157821337-157821430(hg19) |
50,32% |
||
PTGER4 Méthylation négatif Contrôle |
chr5:40681482-40681593(hg19) |
0,78% |
||||
PTGER4 Méthylation négatif Contrôle |
chr5:40681898-40682110(hg19) |
0,40% |
||||
RASSF1A Méthylation négatif Contrôle |
chr3:50378322-50378233(hg19) |
0,00% |
||||
Classification |
Chat n° |
Nom |
Description |
Région |
Niveau de méthylation |
|
Étalon de référence SHOX2 simple positif |
Segment SHOX2 positif unique - Référence de méthylation hautement positive -1 |
CBPE0206-6 |
SHOX2 Haute Référence de méthylation positive ，RASSF1A,PTGER4 négative Méthylation |
Étalon de référence de méthylation SHOX2 à 50,00 % |
chr3:157821337-157821430 (hg19) |
50,32% |
pour la méthylation PTGER4 négatif Étalon de référence |
chr5:40681482-40681593 (hg19) |
0,78% |
||||
pour la méthylation PTGER4 négatif Étalon de référence |
chr5:40681898-40682110 (hg19) |
0,40% |
||||
pour la méthylation RASSF1A négatif Étalon de référence |
chr3:50378322-50378233 (hg19) |
0,00% |
||||
Segment SHOX2 positif unique - Référence de méthylation hautement positive -2 |
CBPE0206-7 |
SHOX2 Haute Référence de méthylation positive ，RASSF1A,PTGER4 négative Méthylation |
Étalon de référence de méthylation SHOX2 à 10,00 % |
chr3:157821337-157821430 (hg19) |
9,44% |
|
pour la méthylation PTGER4 négatif Étalon de référence |
chr5:40681482-40681593 (hg19) |
0,00% |
||||
pour la méthylation PTGER4 négatif Étalon de référence |
chr5:40681898-40682110 (hg19) |
0,00% |
||||
pour la méthylation RASSF1A négatif Étalon de référence |
chr3:50378322-50378233 (hg19) |
0,00% |
||||
Segment SHOX2 positif unique - faiblement positif Étalon de référence |
CBPE0206-8 |
SHOX2 Faible Référence de méthylation positive ，RASSF1A,PTGER4 négative Méthylation |
Étalon de référence de méthylation SHOX2 à 3,00 % |
chr3:157821337-157821430 (hg19) |
N / A |
|
pour la méthylation PTGER4 négatif Étalon de référence |
chr5:40681482-40681593 (hg19) |
N / A |
||||
pour la méthylation PTGER4 négatif Étalon de référence |
chr5:40681898-40682110 (hg19) |
N / A |
||||
pour la méthylation RASSF1A négatif Étalon de référence |
chr3:50378322-50378233 (hg19) |
N / A |
||||
Segment SHOX2 positif unique - LOD référence |
CBPE0206-9 |
SHOX2 LOD Référence de méthylation ，RASSF1A, PTGER4 négative Méthylation |
Étalon de référence de méthylation SHOX2 à 1,00 % |
chr3:157821337-157821430 (hg19) |
1,57% |
|
pour la méthylation PTGER4 négatif Étalon de référence |
chr5:40681482-40681593 (hg19) |
0,30% |
||||
pour la méthylation PTGER4 négatif Étalon de référence |
chr5:40681898-40682110 (hg19) |
0,79% |
||||
pour la méthylation RASSF1A négatif Étalon de référence |
chr3:50378322-50378233 (hg19) |
0,00% |
||||
Segment SHOX2 positif unique - négative Référence |
CBPE0206-10 |
SHOX2 négative de méthylation Référence ，RASSF1A,PTGER4 négative Méthylation |
pour la méthylation SHOX2 négatif Étalon de référence |
chr3:157821337-157821430 (hg19) |
0,00% |
|
pour la méthylation PTGER4 négatif Étalon de référence |
chr5:40681482-40681593 (hg19) |
0,19% |
||||
pour la méthylation PTGER4 négatif Étalon de référence |
chr5:40681898-40682110 (hg19) |
0,05% |
||||
pour la méthylation RASSF1A négatif Étalon de référence |
chr3:50378322-50378233 (hg19) |
0,02% |
||||
Segment SHOX2 positif unique-référence de précision |
CBPE0206-11 |
SHOX2 Faible Référence de méthylation positive ，RASSF1A,PTGER4 négative Méthylation |
Étalon de référence de méthylation SHOX2 à 3,00 % |
chr3:157821337-157821430 (hg19) |
N / A |
|
pour la méthylation PTGER4 négatif Étalon de référence |
chr5:40681482-40681593 (hg19) |
N / A |
||||
pour la méthylation PTGER4 négatif Étalon de référence |
chr5:40681898-40682110 (hg19) |
N / A |
||||
pour la méthylation RASSF1A négatif Étalon de référence |
chr3:50378322-50378233 (hg19) |
N / A |
||||
CBPE0206-12 |
SHOX2 négative Référence de méthylation ，RASSF1A,PTGER4 négative Méthylation |
pour la méthylation SHOX2 négatif Étalon de référence |
chr3:157821337-157821430 (hg19) |
0,00% |
||
pour la méthylation PTGER4 négatif Étalon de référence |
chr5:40681482-40681593 (hg19) |
0,19% |
||||
pour la méthylation PTGER4 négatif Étalon de référence |
chr5:40681898-40682110 (hg19) |
0,05% |
||||
pour la méthylation RASSF1A négatif Étalon de référence |
chr3:50378322-50378233 (hg19) |
0,02% |
||||
Classification |
Chat n° |
Nom |
Description |
Région |
Niveau de méthylation |
|
Étalon de référence PTGER4 simple positif |
Segment PTGER4 simple positif - Référence de méthylation hautement positive -1 |
CBPE0206-13 |
PTGER4 Haute Référence de méthylation positive ，SHOX2 négative Méthylation ，RASSF1A négative Méthylation |
Étalon de référence de méthylation PTGER4 avec 75,00 % |
chr5:40681482-40681593 (hg19) |
79,25% |
Étalon de référence de méthylation PTGER4 à 80,00 % |
chr5:40681898-40682110 (hg19) |
84,78% |
||||
pour la méthylation RASSF1A négatif Étalon de référence |
chr3:50378322-50378233 (hg19) |
0,00% |
||||
Étalon de référence négatif pour la méthylation SHOX2 |
chr3:157821337-157821430 (hg19) |
0,12% |
||||
Segment PTGER4 simple positif - Référence de méthylation hautement positive -2 |
CBPE0206-14 |
PTGER4 hautement positive Référence de méthylation ，RASSF1A,SHOX2 négative Méthylation |
Étalon de référence de méthylation PTGER4 à 10,00 % |
chr5:40681482-40681593 (hg19) |
11,17% |
|
Étalon de référence de méthylation PTGER4 à 10,00 % |
chr5:40681898-40682110 (hg19) |
11,33% |
||||
pour la méthylation RASSF1A négatif Étalon de référence |
chr3:50378322-50378233 (hg19) |
0,21% |
||||
pour la méthylation SHOX2 négatif Étalon de référence |
chr3:157821337-157821430 (hg19) |
0,08% |
||||
Segment PTGER4 simple positif - faiblement positif Étalon de référence |
CBPE0206-15 |
PTGER4 Faible Référence de méthylation positive ，RASSF1A,SHOX2 négative Méthylation |
Étalon de référence de méthylation PTGER4 à 3,00 % |
chr5:40681482-40681593 (hg19) |
N / A |
|
Étalon de référence de méthylation PTGER4 à 3,00 % |
chr5:40681898-40682110 (hg19) |
N / A |
||||
pour la méthylation RASSF1A négatif Étalon de référence |
chr3:50378322-50378233 (hg19) |
N / A |
||||
pour la méthylation SHOX2 négatif Étalon de référence |
chr3:157821337-157821430 (hg19) |
N / A |
||||
Segment PTGER4 positif simple - LOD référence |
CBPE0206-16 |
PTGER4 LOD Référence de méthylation ，RASSF1A,SHOX2 négative Méthylation |
Étalon de référence de méthylation PTGER4 à 1,00 % |
chr5:40681482-40681593 (hg19) |
1,30% |
|
Étalon de référence de méthylation PTGER4 à 1,00 % |
chr5:40681898-40682110 (hg19) |
2,35% |
||||
pour la méthylation RASSF1A négatif Étalon de référence |
chr3:50378322-50378233 (hg19) |
0,00% |
||||
pour la méthylation SHOX2 négatif Étalon de référence |
chr3:157821337-157821430 (hg19) |
0,18% |
||||
Segment PTGER4 positif unique - négative Référence |
CBPE0206-17 |
PTGER4 négative Référence de méthylation ，RASSF1A,SHOX2 négative Méthylation |
pour la méthylation PTGER4 négatif Étalon de référence |
chr5:40681482-40681593 (hg19) |
0,19% |
|
pour la méthylation PTGER4 négatif Étalon de référence |
chr5:40681898-40682110 (hg19) |
0,05% |
||||
pour la méthylation RASSF1A négatif Étalon de référence |
chr3:50378322-50378233 (hg19) |
0,02% |
||||
pour la méthylation SHOX2 négatif Étalon de référence |
chr3:157821337-157821430 (hg19) |
0,00% |
||||
Segment PTGER4 simple positif - de précision Référence |
CBPE0206-18 |
PTGER4 Faible Référence de méthylation positive ，RASSF1A,SHOX2 négative Méthylation |
Étalon de référence de méthylation PTGER4 à 3,00 % |
chr5:40681482-40681593 (hg19) |
N / A |
|
pour la méthylation PTGER4 négatif Étalon de référence |
chr5:40681898-40682110 (hg19) |
N / A |
||||
pour la méthylation RASSF1A négatif Étalon de référence |
chr3:50378322-50378233 (hg19) |
N / A |
||||
pour la méthylation SHOX2 négatif Étalon de référence |
chr3:157821337-157821430 (hg19) |
N / A |
||||
CBPE0206-19 |
PTGER4 négative Référence de méthylation ，RASSF1A,SHOX2 négative Méthylation |
pour la méthylation PTGER4 négatif Étalon de référence |
chr5:40681482-40681593 (hg19) |
0,19% |
||
pour la méthylation PTGER4 négatif Étalon de référence |
chr5:40681898-40682110 (hg19) |
0,05% |
||||
pour la méthylation RASSF1A négatif Étalon de référence |
chr3:50378322-50378233 (hg19) |
0,02% |
||||
pour la méthylation SHOX2 négatif Étalon de référence |
chr3:157821337-157821430 (hg19) |
0,00% |
||||
Classification |
Chat n° |
Nom |
Description |
Région |
Niveau de méthylation |
|
RASSF1A simple positifStandard de référence |
Segment RASSF1A positif unique - Référence de méthylation hautement positive -1 |
CBPE0206-20 |
RASSF1A hautement positive Référence de méthylation ，PTGER4,SHOX2 négative Méthylation |
Étalon de référence de méthylation RASSF1A à 80,00 % |
chr3:50378322-50378233 (hg19) |
81,66% |
pour la méthylation PTGER4 négatif Étalon de référence |
chr5:40681482-40681593 (hg19) |
0,54% |
||||
pour la méthylation PTGER4 négatif Étalon de référence |
chr5:40681898-40682110 (hg19) |
0,00% |
||||
pour la méthylation SHOX2 négatif Étalon de référence |
chr3:157821337-157821430 (hg19) |
0,12% |
||||
Segment RASSF1A simple positif - Référence de méthylation hautement positive -2 |
CBPE0206-21 |
RASSF1A hautement positive Référence de méthylation ，PTGER4,SHOX2 négative Méthylation |
Étalon de référence de méthylation RASSF1A à 10,00 % |
chr3:50378322-50378233 (hg19) |
N / A |
|
pour la méthylation PTGER4 négatif Étalon de référence |
chr5:40681482-40681593 (hg19) |
N / A |
||||
pour la méthylation PTGER4 négatif Étalon de référence |
chr5:40681898-40682110 (hg19) |
N / A |
||||
pour la méthylation SHOX2 négatif Étalon de référence |
chr3:157821337-157821430 (hg19) |
N / A |
||||
Segment RASSF1A positif unique - faiblement positif Étalon de référence |
CBPE0206-22 |
RASSF1A Faible Référence de méthylation positive ，PTGER4,SHOX2 négative Méthylation |
Étalon de référence de méthylation RASSF1A à 3,00 % |
chr3:50378322-50378233 (hg19) |
N / A |
|
pour la méthylation PTGER4 négatif Étalon de référence |
chr5:40681482-40681593 (hg19) |
N / A |
||||
pour la méthylation PTGER4 négatif Étalon de référence |
chr5:40681898-40682110 (hg19) |
N / A |
||||
pour la méthylation SHOX2 négatif Étalon de référence |
chr3:157821337-157821430 (hg19) |
N / A |
||||
Segment RASSF1A positif unique - LOD référence |
CBPE0206-23 |
RASSF1A LOD référence de méthylation ，PTGER4,SHOX2 négative Méthylation |
Étalon de référence de méthylation RASSF1A à 1,00 % |
chr3:50378322-50378233 (hg19) |
N / A |
|
pour la méthylation PTGER4 négatif Étalon de référence |
chr5:40681482-40681593 (hg19) |
N / A |
||||
pour la méthylation PTGER4 négatif Étalon de référence |
chr5:40681898-40682110 (hg19) |
N / A |
||||
pour la méthylation SHOX2 négatif Étalon de référence |
chr3:157821337-157821430 (hg19) |
N / A |
||||
Segment RASSF1A positif unique - négative Référence |
CBPE0206-24 |
RASSF1A négative Référence de méthylation ，PTGER4,SHOX2 négative Méthylation |
pour la méthylation RASSF1A négatif Étalon de référence |
chr3:50378322-50378233 (hg19) |
0,02% |
|
pour la méthylation PTGER4 négatif Étalon de référence |
chr5:40681482-40681593 (hg19) |
0,19% |
||||
pour la méthylation PTGER4 négatif Étalon de référence |
chr5:40681898-40682110 (hg19) |
0,05% |
||||
pour la méthylation SHOX2 négatif Étalon de référence |
chr3:157821337-157821430 (hg19) |
0,00% |
||||
Segment RASSF1A positif unique - Référence de précision |
CBPE0206-25 |
RASSF1A Faible Référence de méthylation positive ，PTGER4,SHOX2 négative Méthylation |
Étalon de référence de méthylation RASSF1A à 3,00 % |
chr3:50378322-50378233 (hg19) |
N / A |
|
pour la méthylation PTGER4 négatif Étalon de référence |
chr5:40681482-40681593 (hg19) |
N / A |
||||
pour la méthylation PTGER4 négatif Étalon de référence |
chr5:40681898-40682110 (hg19) |
N / A |
||||
pour la méthylation SHOX2 négatif Étalon de référence |
chr3:157821337-157821430 (hg19) |
N / A |
||||
CBPE0206-26 |
RASSF1A4 négative Référence de méthylation ，PTGER4,SHOX2 négative Méthylation |
pour la méthylation RASSF1A négatif Étalon de référence |
chr3:50378322-50378233 (hg19) |
0,02% |
||
pour la méthylation PTGER4 négatif Étalon de référence |
chr5:40681482-40681593 (hg19) |
0,19% |
||||
pour la méthylation PTGER4 négatif Étalon de référence |
chr5:40681898-40682110 (hg19) |
0,05% |
||||
pour la méthylation SHOX2 négatif Étalon de référence |
chr3:157821337-157821430 (hg19) |
0,00% |
||||
Remarque |
1. Les produits de contrôle qualité sont également appelés normes de précision et sont utilisés pour un jugement qualitatif ; 2. Les produits de référence sont utilisés pour des jugements qualitatifs et quantitatifs. Le jugement du positif fort, du positif faible, de la limite de détection, de la précision et de la spécificité dépend du projet spécifique. Le jugement de ce produit n'est qu'une norme interne ; 3. Les produits de contrôle qualité sont utilisés pour l'évaluation des performances, l'inspection en usine ainsi que la détection et le jugement quotidiens des kits de test. Les produits de référence sont utilisés pour l'évaluation des performances et l'inspection en usine ; 4. Les produits ci-dessus ne montrent qu'une partie des résultats et le degré de méthylation peut être personnalisé. |
|||||
Scénario d'application
① Contrôle interne du processus de test : dans un test de méthylation d'un échantillon clinique, les échecs dans l'une des étapes, depuis l'extraction de l'ADN et la conversion du sulfite (une étape clé qui convertit le C non méthylé en U) jusqu'à l'amplification et la détection par PCR finale, peuvent entraîner un résultat faussement négatif. Si un échantillon fortement suspecté de cancer du poumon (tel qu'un liquide de lavage broncho-alvéolaire) ne parvient pas à détecter les signaux de méthylation pour l'un de ces trois gènes, cela suggère fortement un éventuel problème de protocole (tel qu'une dégradation de l'ADN, une faible efficacité de conversion ou une inhibition de la PCR), indiquant que les résultats du test ne sont pas fiables et nécessitent des tests répétés. Cela évite efficacement les diagnostics manqués dus à des erreurs techniques.
②Panels de biomarqueurs complémentaires et synergiques : la combinaison de ces trois gènes dans un seul panel de test peut couvrir un plus large éventail de patients atteints d'un cancer du poumon et améliorer la sensibilité globale des tests. Les profils de méthylation des cellules cancéreuses peuvent varier légèrement d’un patient à l’autre. Le test simultané de plusieurs marqueurs maximise la capture des signaux positifs et garantit la fiabilité du test.
③Garantir une interprétation fiable des résultats : en tant que contrôles internes positifs stables, ils aident à confirmer que le système de détection lui-même fonctionne correctement, permettant aux chercheurs d'interpréter en toute confiance l'état de méthylation d'autres gènes cibles (qu'ils soient positifs ou négatifs), produisant finalement un rapport de test clinique précis et fiable.
En résumé, SHOX2, PTGER4 et RASSF1A, en raison de leur haute fréquence et de leur méthylation spécifique dans le cancer du poumon, sont utilisés en combinaison comme « contrôles de qualité » dans les tests de méthylation du cancer du poumon. Leur fonction principale est de surveiller la qualité de l’ensemble du processus expérimental, de garantir l’exactitude et la fiabilité des résultats des tests et d’éviter les faux négatifs. Ils jouent un rôle crucial de contrôle de qualité dans le diagnostic précoce non invasif et le suivi de l’efficacité du cancer du poumon.
informations générales
Nom |
Package-Ref™ Cancer du poumon SHOX2/PTGER4/RASSF1A pour le contrôle de la méthylation |
Chat. Non. |
CBPE0206 |
Format |
ADN génomique |
Taille |
1ug |
Tampon |
Tris-EDTA |
Utilisation prévue |
Utilisation pour la recherche uniquement |
Concentration |
Télécharger pour le COA |
Pureté |
Télécharger pour le COA |
Électrophorèse de l'ADN |
Télécharger pour le COA |
Conditions de stockage |
2 ~ 8 ℃ |
Expiration |
36 mois à compter de la date de fabrication |
Remarque |
Les données contenues dans le manuel d'instructions sont les données d'un seul test, et les données spécifiques de chaque lot sont soumises à la livraison. |
Données techniques
Classification |
Chat n° |
Nom |
Description |
Région |
Niveau de méthylation |
|
norme de contrôle de qualité |
CBPE0206-1 |
Cancer du poumon -SHOX2, PTGER4, RASSF1A positive Méthylation |
SHOX2 Méthylation positif Contrôle |
chr3:157821337-157821430(hg19) |
97,43% |
|
de méthylation PTGER4 positif Contrôle |
chr5:40681482-40681593(hg19) |
99,76% |
||||
de méthylation PTGER4 positif Contrôle |
chr5:40681898-40682110(hg19) |
96,26% |
||||
RASSF1A Méthylation positif Contrôle |
chr3:50378322-50378233(hg19) |
99,33% |
||||
CBPE0206-2 |
Cancer du poumon -SHOX2, PTGER4, RASSF1A négative Méthylation |
SHOX2 Méthylation négatif Contrôle |
chr3:157821337-157821430(hg19) |
0,00% |
||
PTGER4 Méthylation négatif Contrôle |
chr5:40681482-40681593(hg19) |
0,19% |
||||
PTGER4 Méthylation négatif Contrôle |
chr5:40681898-40682110(hg19) |
0,05% |
||||
RASSF1A Méthylation négatif Contrôle |
chr3:50378322-50378233(hg19) |
0,02% |
||||
CBPE0206-3 |
Cancer du poumon -PTGER4 Élevé Référence de méthylation positive ，SHOX2 négative Méthylation ,RASSF1A négative Méthylation |
SHOX2 Méthylation négatif Contrôle |
chr3:157821337-157821430(hg19) |
0,12% |
||
de méthylation PTGER4 positif Contrôle |
chr5:40681482-40681593(hg19) |
79,25% |
||||
de méthylation PTGER4 positif Contrôle |
chr5:40681898-40682110(hg19) |
84,78% |
||||
RASSF1A Méthylation négatif Contrôle |
chr3:50378322-50378233(hg19) |
0,00% |
||||
CBPE0206-4 |
Cancer du poumon -SHOX2, PTGER4 négative Méthylation ，RASSF1A positive Méthylation |
SHOX2 Méthylation négatif Contrôle |
chr3:157821337-157821430(hg19) |
0,12% |
||
PTGER4 Méthylation négatif Contrôle |
chr5:40681482-40681593(hg19) |
0,54% |
||||
PTGER4 Méthylation négatif Contrôle |
chr5:40681898-40682110(hg19) |
0,00% |
||||
RASSF1A Méthylation positif Contrôle |
chr3:50378322-50378233(hg19) |
81,66% |
||||
CBPE0206-5 |
Cancer du poumon -RASSF1A,PTGER4 négative Méthylation ，SHOX2 positive Méthylation |
SHOX2 Méthylation positif Contrôle |
chr3:157821337-157821430(hg19) |
50,32% |
||
PTGER4 Méthylation négatif Contrôle |
chr5:40681482-40681593(hg19) |
0,78% |
||||
PTGER4 Méthylation négatif Contrôle |
chr5:40681898-40682110(hg19) |
0,40% |
||||
RASSF1A Méthylation négatif Contrôle |
chr3:50378322-50378233(hg19) |
0,00% |
||||
Classification |
Chat n° |
Nom |
Description |
Région |
Niveau de méthylation |
|
simple positif SHOX2 Standard de référence |
positif unique SHOX2 Segment -hautement positive Référence de méthylation -1 |
CBPE0206-6 |
SHOX2 Haute Référence de méthylation positive ，RASSF1A,PTGER4 négative Méthylation |
Étalon de référence de méthylation SHOX2 à 50,00 % |
chr3:157821337-157821430 (hg19) |
50,32% |
pour la méthylation PTGER4 négatif Étalon de référence |
chr5:40681482-40681593 (hg19) |
0,78% |
||||
pour la méthylation PTGER4 négatif Étalon de référence |
chr5:40681898-40682110 (hg19) |
0,40% |
||||
pour la méthylation RASSF1A négatif Étalon de référence |
chr3:50378322-50378233 (hg19) |
0,00% |
||||
positif unique SHOX2 Segment -hautement positive Référence de méthylation -2 |
CBPE0206-7 |
SHOX2 Haute Référence de méthylation positive ，RASSF1A,PTGER4 négative Méthylation |
Étalon de référence de méthylation SHOX2 à 10,00 % |
chr3:157821337-157821430 (hg19) |
9,44% |
|
pour la méthylation PTGER4 négatif Étalon de référence |
chr5:40681482-40681593 (hg19) |
0,00% |
||||
pour la méthylation PTGER4 négatif Étalon de référence |
chr5:40681898-40682110 (hg19) |
0,00% |
||||
pour la méthylation RASSF1A négatif Étalon de référence |
chr3:50378322-50378233 (hg19) |
0,00% |
||||
positif unique SHOX2 Segment Étalon -faiblement positif de référence |
CBPE0206-8 |
SHOX2 Faible Référence de méthylation positive ，RASSF1A,PTGER4 négative Méthylation |
Étalon de référence de méthylation SHOX2 à 3,00 % |
chr3:157821337-157821430 (hg19) |
N / A |
|
pour la méthylation PTGER4 négatif Étalon de référence |
chr5:40681482-40681593 (hg19) |
N / A |
||||
pour la méthylation PTGER4 négatif Étalon de référence |
chr5:40681898-40682110 (hg19) |
N / A |
||||
pour la méthylation RASSF1A négatif Étalon de référence |
chr3:50378322-50378233 (hg19) |
N / A |
||||
positif unique SHOX2 du segment - LOD Référence |
CBPE0206-9 |
SHOX2 LOD Référence de méthylation ，RASSF1A, PTGER4 négative Méthylation |
Étalon de référence de méthylation SHOX2 à 1,00 % |
chr3:157821337-157821430 (hg19) |
1,57% |
|
pour la méthylation PTGER4 négatif Étalon de référence |
chr5:40681482-40681593 (hg19) |
0,30% |
||||
pour la méthylation PTGER4 négatif Étalon de référence |
chr5:40681898-40682110 (hg19) |
0,79% |
||||
pour la méthylation RASSF1A négatif Étalon de référence |
chr3:50378322-50378233 (hg19) |
0,00% |
||||
positif unique SHOX2 Segment -négative Référence |
CBPE0206-10 |
SHOX2 négative de méthylation Référence ，RASSF1A,PTGER4 négative Méthylation |
pour la méthylation SHOX2 négatif Étalon de référence |
chr3:157821337-157821430 (hg19) |
0,00% |
|
pour la méthylation PTGER4 négatif Étalon de référence |
chr5:40681482-40681593 (hg19) |
0,19% |
||||
pour la méthylation PTGER4 négatif Étalon de référence |
chr5:40681898-40682110 (hg19) |
0,05% |
||||
pour la méthylation RASSF1A négatif Étalon de référence |
chr3:50378322-50378233 (hg19) |
0,02% |
||||
positif unique SHOX2 Segment -Référence de précision |
CBPE0206-11 |
SHOX2 Faible Référence de méthylation positive ，RASSF1A,PTGER4 négative Méthylation |
Étalon de référence de méthylation SHOX2 à 3,00 % |
chr3:157821337-157821430 (hg19) |
N / A |
|
pour la méthylation PTGER4 négatif Étalon de référence |
chr5:40681482-40681593 (hg19) |
N / A |
||||
pour la méthylation PTGER4 négatif Étalon de référence |
chr5:40681898-40682110 (hg19) |
N / A |
||||
pour la méthylation RASSF1A négatif Étalon de référence |
chr3:50378322-50378233 (hg19) |
N / A |
||||
CBPE0206-12 |
SHOX2 négative Référence de méthylation ，RASSF1A,PTGER4 négative Méthylation |
pour la méthylation SHOX2 négatif Étalon de référence |
chr3:157821337-157821430 (hg19) |
0,00% |
||
pour la méthylation PTGER4 négatif Étalon de référence |
chr5:40681482-40681593 (hg19) |
0,19% |
||||
pour la méthylation PTGER4 négatif Étalon de référence |
chr5:40681898-40682110 (hg19) |
0,05% |
||||
pour la méthylation RASSF1A négatif Étalon de référence |
chr3:50378322-50378233 (hg19) |
0,02% |
||||
Classification |
Chat n° |
Nom |
Description |
Région |
Niveau de méthylation |
|
Simple Positif PTGER4- étalon de référence |
simple positif PTGER4 du segment -hautement positive Référence de méthylation -1 |
CBPE0206-13 |
PTGER4 Haute Référence de méthylation positive ，SHOX2 négative Méthylation ，RASSF1A négative Méthylation |
Étalon de référence de méthylation PTGER4 avec 75,00 % |
chr5:40681482-40681593 (hg19) |
79,25% |
Étalon de référence de méthylation PTGER4 à 80,00 % |
chr5:40681898-40682110 (hg19) |
84,78% |
||||
pour la méthylation RASSF1A négatif Étalon de référence |
chr3:50378322-50378233 (hg19) |
0,00% |
||||
Étalon de référence négatif pour la méthylation SHOX2 |
chr3:157821337-157821430 (hg19) |
0,12% |
||||
simple positif PTGER4 du segment -hautement positive Référence de méthylation -2 |
CBPE0206-14 |
PTGER4 hautement positive Référence de méthylation ，RASSF1A,SHOX2 négative Méthylation |
Étalon de référence de méthylation PTGER4 à 10,00 % |
chr5:40681482-40681593 (hg19) |
11,17% |
|
Étalon de référence de méthylation PTGER4 à 10,00 % |
chr5:40681898-40682110 (hg19) |
11,33% |
||||
pour la méthylation RASSF1A négatif Étalon de référence |
chr3:50378322-50378233 (hg19) |
0,21% |
||||
pour la méthylation SHOX2 négatif Étalon de référence |
chr3:157821337-157821430 (hg19) |
0,08% |
||||
positif simple, PTGER4 Segment -faiblement positif étalon de référence |
CBPE0206-15 |
PTGER4 Faible Référence de méthylation positive ，RASSF1A,SHOX2 négative Méthylation |
Étalon de référence de méthylation PTGER4 à 3,00 % |
chr5:40681482-40681593 (hg19) |
N / A |
|
Étalon de référence de méthylation PTGER4 à 3,00 % |
chr5:40681898-40682110 (hg19) |
N / A |
||||
pour la méthylation RASSF1A négatif Étalon de référence |
chr3:50378322-50378233 (hg19) |
N / A |
||||
pour la méthylation SHOX2 négatif Étalon de référence |
chr3:157821337-157821430 (hg19) |
N / A |
||||
positif unique PTGER4 du segment - LOD Référence |
CBPE0206-16 |
PTGER4 LOD Référence de méthylation ，RASSF1A,SHOX2 négative Méthylation |
Étalon de référence de méthylation PTGER4 à 1,00 % |
chr5:40681482-40681593 (hg19) |
1,30% |
|
Étalon de référence de méthylation PTGER4 à 1,00 % |
chr5:40681898-40682110 (hg19) |
2,35% |
||||
pour la méthylation RASSF1A négatif Étalon de référence |
chr3:50378322-50378233 (hg19) |
0,00% |
||||
pour la méthylation SHOX2 négatif Étalon de référence |
chr3:157821337-157821430 (hg19) |
0,18% |
||||
positif unique PTGER4 Segment -négative Référence |
CBPE0206-17 |
PTGER4 négative Référence de méthylation ，RASSF1A,SHOX2 négative Méthylation |
pour la méthylation PTGER4 négatif Étalon de référence |
chr5:40681482-40681593 (hg19) |
0,19% |
|
pour la méthylation PTGER4 négatif Étalon de référence |
chr5:40681898-40682110 (hg19) |
0,05% |
||||
pour la méthylation RASSF1A négatif Étalon de référence |
chr3:50378322-50378233 (hg19) |
0,02% |
||||
pour la méthylation SHOX2 négatif Étalon de référence |
chr3:157821337-157821430 (hg19) |
0,00% |
||||
simple positif PTGER4 Segment -de précision Référence |
CBPE0206-18 |
PTGER4 Faible Référence de méthylation positive ，RASSF1A,SHOX2 négative Méthylation |
Étalon de référence de méthylation PTGER4 à 3,00 % |
chr5:40681482-40681593 (hg19) |
N / A |
|
pour la méthylation PTGER4 négatif Étalon de référence |
chr5:40681898-40682110 (hg19) |
N / A |
||||
pour la méthylation RASSF1A négatif Étalon de référence |
chr3:50378322-50378233 (hg19) |
N / A |
||||
pour la méthylation SHOX2 négatif Étalon de référence |
chr3:157821337-157821430 (hg19) |
N / A |
||||
CBPE0206-19 |
PTGER4 négative Référence de méthylation ，RASSF1A,SHOX2 négative Méthylation |
pour la méthylation PTGER4 négatif Étalon de référence |
chr5:40681482-40681593 (hg19) |
0,19% |
||
pour la méthylation PTGER4 négatif Étalon de référence |
chr5:40681898-40682110 (hg19) |
0,05% |
||||
pour la méthylation RASSF1A négatif Étalon de référence |
chr3:50378322-50378233 (hg19) |
0,02% |
||||
pour la méthylation SHOX2 négatif Étalon de référence |
chr3:157821337-157821430 (hg19) |
0,00% |
||||
Classification |
Chat n° |
Nom |
Description |
Région |
Niveau de méthylation |
|
simple positif RASSF1A Standard de référence |
simple positif RASSF1A Segment -hautement positive Référence de méthylation -1 |
CBPE0206-20 |
RASSF1A hautement positive Référence de méthylation ，PTGER4,SHOX2 négative Méthylation |
Étalon de référence de méthylation RASSF1A à 80,00 % |
chr3:50378322-50378233 (hg19) |
81,66% |
pour la méthylation PTGER4 négatif Étalon de référence |
chr5:40681482-40681593 (hg19) |
0,54% |
||||
pour la méthylation PTGER4 négatif Étalon de référence |
chr5:40681898-40682110 (hg19) |
0,00% |
||||
pour la méthylation SHOX2 négatif Étalon de référence |
chr3:157821337-157821430 (hg19) |
0,12% |
||||
simple positif RASSF1A Segment -hautement positive Référence de méthylation -2 |
CBPE0206-21 |
RASSF1A hautement positive Référence de méthylation ，PTGER4,SHOX2 négative Méthylation |
Étalon de référence de méthylation RASSF1A à 10,00 % |
chr3:50378322-50378233 (hg19) |
N / A |
|
pour la méthylation PTGER4 négatif Étalon de référence |
chr5:40681482-40681593 (hg19) |
N / A |
||||
pour la méthylation PTGER4 négatif Étalon de référence |
chr5:40681898-40682110 (hg19) |
N / A |
||||
pour la méthylation SHOX2 négatif Étalon de référence |
chr3:157821337-157821430 (hg19) |
N / A |
||||
simple positif RASSF1A Segment -faiblement positif Étalon de référence |
CBPE0206-22 |
RASSF1A Faible Référence de méthylation positive ，PTGER4,SHOX2 négative Méthylation |
Étalon de référence de méthylation RASSF1A à 3,00 % |
chr3:50378322-50378233 (hg19) |
N / A |
|
pour la méthylation PTGER4 négatif Étalon de référence |
chr5:40681482-40681593 (hg19) |
N / A |
||||
pour la méthylation PTGER4 négatif Étalon de référence |
chr5:40681898-40682110 (hg19) |
N / A |
||||
pour la méthylation SHOX2 négatif Étalon de référence |
chr3:157821337-157821430 (hg19) |
N / A |
||||
positif unique RASSF1A du segment - LOD Référence |
CBPE0206-23 |
RASSF1A LOD référence de méthylation ，PTGER4,SHOX2 négative Méthylation |
Étalon de référence de méthylation RASSF1A à 1,00 % |
chr3:50378322-50378233 (hg19) |
N / A |
|
pour la méthylation PTGER4 négatif Étalon de référence |
chr5:40681482-40681593 (hg19) |
N / A |
||||
pour la méthylation PTGER4 négatif Étalon de référence |
chr5:40681898-40682110 (hg19) |
N / A |
||||
pour la méthylation SHOX2 négatif Étalon de référence |
chr3:157821337-157821430 (hg19) |
N / A |
||||
unique positif RASSF1A Segment -négative Référence |
CBPE0206-24 |
RASSF1A négative Référence de méthylation ，PTGER4,SHOX2 négative Méthylation |
pour la méthylation RASSF1A négatif Étalon de référence |
chr3:50378322-50378233 (hg19) |
0,02% |
|
pour la méthylation PTGER4 négatif Étalon de référence |
chr5:40681482-40681593 (hg19) |
0,19% |
||||
pour la méthylation PTGER4 négatif Étalon de référence |
chr5:40681898-40682110 (hg19) |
0,05% |
||||
pour la méthylation SHOX2 négatif Étalon de référence |
chr3:157821337-157821430 (hg19) |
0,00% |
||||
positif simple RASSF1A Segment -Référence de précision |
CBPE0206-25 |
RASSF1A Faible Référence de méthylation positive ，PTGER4,SHOX2 négative Méthylation |
de référence de méthylation RASSF1A Norme avec 3,00 % |
chr3:50378322-50378233 (hg19) |
N / A |
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pour la méthylation PTGER4 négatif Étalon de référence |
chr5:40681482-40681593 (hg19) |
N / A |
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pour la méthylation PTGER4 négatif Étalon de référence |
chr5:40681898-40682110 (hg19) |
N / A |
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pour la méthylation SHOX2 négatif Étalon de référence |
chr3:157821337-157821430 (hg19) |
N / A |
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CBPE0206-26 |
RASSF1A4 négative Référence de méthylation ，PTGER4,SHOX2 négative Méthylation |
pour la méthylation RASSF1A négatif Étalon de référence |
chr3:50378322-50378233 (hg19) |
0,02% |
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pour la méthylation PTGER4 négatif Étalon de référence |
chr5:40681482-40681593 (hg19) |
0,19% |
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pour la méthylation PTGER4 négatif Étalon de référence |
chr5:40681898-40682110 (hg19) |
0,05% |
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pour la méthylation SHOX2 négatif Étalon de référence |
chr3:157821337-157821430 (hg19) |
0,00% |
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Remarque |
1.Les produits de contrôle qualité sont également appelés normes d'exactitude et sont utilisés pour un jugement qualitatif ; 2. Les produits de référence sont utilisés pour des jugements qualitatifs et quantitatifs. Le jugement du positif fort, du positif faible, de la limite de détection, de la précision et de la spécificité dépend du projet spécifique. Le jugement de ce produit n'est qu'une norme interne ; 3. Les produits de contrôle qualité sont utilisés pour l'évaluation des performances, l'inspection en usine ainsi que la détection et le jugement quotidiens des kits de test. Les produits de référence sont utilisés pour l'évaluation des performances et l'inspection en usine ; 4. Les produits ci-dessus ne montrent qu'une partie des résultats et le degré de méthylation peut être personnalisé. |
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Scénario d'application
① Contrôle interne du processus de test : dans un test de méthylation d'un échantillon clinique, les échecs dans l'une des étapes, depuis l'extraction de l'ADN et la conversion du sulfite (une étape clé qui convertit le C non méthylé en U) jusqu'à l'amplification et la détection par PCR finale, peuvent entraîner un résultat faussement négatif. Si un échantillon fortement suspecté de cancer du poumon (tel qu'un liquide de lavage broncho-alvéolaire) ne parvient pas à détecter les signaux de méthylation pour l'un de ces trois gènes, cela suggère fortement un éventuel problème de protocole (tel qu'une dégradation de l'ADN, une faible efficacité de conversion ou une inhibition de la PCR), indiquant que les résultats du test ne sont pas fiables et nécessitent des tests répétés. Cela évite efficacement les diagnostics manqués dus à des erreurs techniques.
②Panels de biomarqueurs complémentaires et synergiques : la combinaison de ces trois gènes dans un seul panel de test peut couvrir un plus large éventail de patients atteints d'un cancer du poumon et améliorer la sensibilité globale des tests. Les profils de méthylation des cellules cancéreuses peuvent varier légèrement d’un patient à l’autre. Le test simultané de plusieurs marqueurs maximise la capture des signaux positifs et garantit la fiabilité du test.
③Garantir une interprétation fiable des résultats : en tant que contrôles internes positifs stables, ils aident à confirmer que le système de détection lui-même fonctionne correctement, permettant aux chercheurs d'interpréter en toute confiance l'état de méthylation d'autres gènes cibles (qu'ils soient positifs ou négatifs), produisant finalement un rapport de test clinique précis et fiable.
En résumé, SHOX2, PTGER4 et RASSF1A, en raison de leur haute fréquence et de leur méthylation spécifique dans le cancer du poumon, sont utilisés en combinaison comme « contrôles de qualité » dans les tests de méthylation du cancer du poumon. Leur fonction principale est de surveiller la qualité de l’ensemble du processus expérimental, de garantir l’exactitude et la fiabilité des résultats des tests et d’éviter les faux négatifs. Ils jouent un rôle crucial de contrôle de qualité dans le diagnostic précoce non invasif et le suivi de l’efficacité du cancer du poumon.
