FFPE KRAS 5 % Section Réf. Norme pour la mutation

Présentation du produit

Ce produit délivre 4 μm pré-préparés de tissu tumoral muté par KRAS avec une fréquence d'allèles mutants précisément définie de 5 % , représentant le scénario difficile mais cliniquement pertinent de détection de mutations rares dans des échantillons de tumeurs hétérogènes. Contrairement aux normes de blocs entiers, ces sections individuelles permettent aux chercheurs d'imiter les conditions pré-analytiques exactes du traitement des échantillons cliniques, de la section à l'analyse des mutations.

Caractéristiques du produit

Conception de section ultra fine

Les coupes de 4 μm reproduisent l’épaisseur typique utilisée en histopathologie clinique, garantissant une simulation précise de l’efficacité de l’extraction d’ADN à partir d’échantillons de patients réels. Cette conception est particulièrement utile pour optimiser les protocoles qui répondent aux défis spécifiques à la FFPE tels que la réticulation et la fragmentation des acides nucléiques.

Spectre de mutation vérifié

Chaque section contient un mélange caractérisé de cellules mutées par KRAS et de type sauvage.

Concernant les mutations KRAS, nous disposons d'un total de neuf produits, chacun contenant les variants G13D, G12A, G12C, A146T, G12R, G12D, G12V, G12S et Q61H. Ces mutations sont fréquemment observées dans les cancers colorectaux, du poumon et du pancréas. Les fréquences alléliques sont vérifiées à la fois par ddPCR et NGS, garantissant une précision à ± 30 % de la valeur nominale de 5 %.

Capacité de contrôle des processus

La norme comprend des marqueurs intégrés pour surveiller les variables pré-analytiques telles que la dégradation de l'ADN et l'inhibition de la PCR, permettant aux laboratoires d'identifier les inefficacités du flux de travail susceptibles de compromettre la sensibilité de la détection des mutations.

Usage

Manipulation optimale des sections

Conserver les coupes entre -25 °C et -15 °C jusqu'à utilisation et éviter une exposition prolongée aux conditions ambiantes. Utilisez des pinces stériles pour transférer les sections vers des tubes d’extraction afin d’éviter toute contamination et de préserver l’intégrité de l’ADN.

Optimisation des extractions

Traitez les sections à l’aide du protocole d’extraction d’ADN FFPE standard de votre laboratoire, avec les modifications nécessaires pour maximiser la récupération à partir de matériel à faible apport. Nous recommandons d'utiliser des kits d'extraction spécialement formulés pour les échantillons FFPE afin de résoudre les problèmes de réticulation.

Test de sensibilité du test

Utiliser la norme pour :

• Déterminer la limite de détection des mutations KRAS dans les échantillons FFPE

• Valider les performances des tests sur différents quarts de travail des opérateurs

• Comparez l'efficacité d'extraction de divers kits commerciaux

• Optimiser la préparation de la bibliothèque NGS pour l'ADN FFPE à faible apport

FAQ

Quel est le rendement en ADN par section ?

Chaque section de 4 μm produit généralement 100 à 200 ng d'ADN lors de l'utilisation de protocoles d'extraction optimisés, ce qui est suffisant pour 2 à 3 réactions qPCR ou une seule préparation de bibliothèque NGS.

Cette norme peut-elle être utilisée pour valider les tests PCR numériques ?

Absolument. La fréquence allélique de 5 %, calibrée avec précision, le rend idéal pour valider les flux de travail ddPCR, notamment pour déterminer la précision, la linéarité et le biais des tests sur la plage cliniquement pertinente.

Comment ce produit prend-il en charge la validation des panneaux NGS ?

Le profil de mutation connu de la norme permet aux laboratoires de vérifier que leurs panels NGS peuvent détecter de manière fiable les mutations KRAS basse fréquence dans un contexte de type sauvage, une caractéristique de performance essentielle pour les tests en oncologie.

Numéro de cat.	Nom	Format	Épaisseur de tranche	Taille de l'unité	Utilisation prévue	Stockage	Expiration
CBPS0001FC-5%	Section FFPE de l'étalon de référence KRAS p.G13D 5 %	Section FFPE	4μm	1 Section FFPE	Utilisation pour la recherche uniquement	-25 ℃ ~ -15 ℃	36 mois
CBPS0002FC-5%	Section FFPE de l'étalon de référence KRAS p.G12A 5 %	Section FFPE	4µm​	1 Section FFPE	Utilisation pour la recherche uniquement	-25 ℃ ~ -15 ℃	36 mois
CBPS0003FC-5%	Section FFPE de l'étalon de référence KRAS p.G12C 5 %	Section FFPE	4µm​	1 Section FFPE	Utilisation pour la recherche uniquement	-25 ℃ ~ -15 ℃	36 mois
CBPS0004FC-5%	Section FFPE de l'étalon de référence KRAS p.A146T 5 %1	Section FFPE	4µm​	1 Section FFPE	Utilisation pour la recherche uniquement	-25 ℃ ~ -15 ℃	36 mois
CBPS0005FC-5%	Section FFPE de l'étalon de référence KRAS p.G12R 5 %	Section FFPE	4µm​	1 Section FFPE	Utilisation pour la recherche uniquement	-25 ℃ ~ -15 ℃	36 mois
CBPS0006FC-5%	Section FFPE de l'étalon de référence KRAS p.G12D 5 %	Section FFPE	4µm​	1 Section FFPE	Utilisation pour la recherche uniquement	-25 ℃ ~ -15 ℃	36 mois
CBPS0007FC-5%	Section FFPE de l'étalon de référence KRAS p.G12V 5 %	Section FFPE	4µm​	1 Section FFPE	Utilisation pour la recherche uniquement	-25 ℃ ~ -15 ℃	36 mois
CBPS0008FC-5%	Section FFPE  de l'étalon de référence KRAS p.G12S 5 %	Section FFPE	4µm​	1 Section FFPE	Utilisation pour la recherche uniquement	-25 ℃ ~ -15 ℃	36 mois
CBPS0009FC-5%	Section FFPE de l'étalon de référence KRAS p.Q61H 5 %	Section FFPE	4µm​	1 Section FFPE	Utilisation pour la recherche uniquement	-25 ℃ ~ -15 ℃	36 mois

Données techniques

Numéro de cat.	Nom	Changement d'ADN	Changement AA	Zygosité	Fréquence allélique	Transcription	ID cosmique	Position Chr(GRCh37)
CBPS0001FC-5%	Section FFPE de l'étalon de référence KRAS p.G13D 5 %	c.38G>A	p.G13D	Hétérozygote	5%	ENST00000311936	COSM532	ch12:25398281
CBPS0002FC-5%	Section FFPE de l'étalon de référence KRAS p.G12A 5 %	c.35G>C	p.G12A	Hétérozygote	5%	ENST00000311936	COSM522	ch12:25398284
CBPS0003FC-5%	Section FFPE de l'étalon de référence KRAS p.G12C 5 %	c.34G>T	p.G12C	Hétérozygote	5%	ENST00000311936	COSM516	chr12:25398285
CBPS0004FC-5%	Section FFPE de l'étalon de référence KRAS p.A146T 5 %1	c.436G>A	p.A146T	Hétérozygote	5%	NM_033360.4	COSM19404	chr12:25378562
CBPS0005FC-5%	Section FFPE de l'étalon de référence KRAS p.G12R 5 %	c.34G>C	p.G12R	Hétérozygote	5%	ENST00000311936	COSM518	chr12:25398285
CBPS0006FC-5%	Section FFPE de l'étalon de référence KRAS p.G12D 5 %	environ 35G>A	p.G12D	Hétérozygote	5%	ENST00000311936	COSM521	ch12:25398284
CBPS0007FC-5%	Section FFPE de l'étalon de référence KRAS p.G12V 5 %	environ 35G>T	p.G12V	Hétérozygote	5%	ENST00000311936	COSM520	ch12:25398284
CBPS0008FC-5%	Section FFPE  de l'étalon de référence KRAS p.G12S 5 %	c.34G>A	p.G12S	Hétérozygote	5%	ENST00000311936	COSM517	chr12:25398285
CBPS0009FC-5%	Section FFPE de l'étalon de référence KRAS p.Q61H 5 %	c.183A>T	p.Q61H	Hétérozygote	5%	ENST00000311936	COSM555	ch12:25380275