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El FFPE KRAS 5% Sección Ref Std para Mutación es un material de referencia avanzado diseñado específicamente para validar flujos de trabajo de detección de mutaciones de baja frecuencia en muestras fijadas con formalina e incluidas en parafina (FFPE).
CBPS0001/2/3/4/5/6/7/8/9FC-5%
CBPS0001/2/3/4/5/6/7/8/9FC-5%
| Disponibilidad: | |
|---|---|
Este producto proporciona 4 μm de tejido tumoral mutado con KRAS preparado previamente con una frecuencia de alelo mutante definida con precisión del 5 % , lo que representa el escenario desafiante pero clínicamente relevante de detectar mutaciones raras en muestras de tumores heterogéneos. A diferencia de los estándares de bloque completo, estas secciones individuales permiten a los investigadores imitar las condiciones preanalíticas exactas del procesamiento de muestras clínicas, desde el corte hasta el análisis de mutaciones.
Las secciones de 4 μm replican el grosor típico utilizado en histopatología clínica, lo que garantiza una simulación precisa de la eficiencia de la extracción de ADN a partir de muestras de pacientes reales. Este diseño es particularmente valioso para optimizar protocolos que abordan desafíos específicos de FFPE, como el entrecruzamiento y la fragmentación de ácidos nucleicos.
Cada sección contiene una mezcla caracterizada de células de tipo salvaje y mutadas en KRAS.
En cuanto a las mutaciones de KRAS, tenemos un total de nueve productos, cada uno de los cuales contiene las variantes G13D, G12A, G12C, A146T, G12R, G12D, G12V, G12S y Q61H. Estas mutaciones se observan con frecuencia en los cánceres colorrectal, de pulmón y de páncreas. Las frecuencias alélicas se verifican mediante ddPCR y NGS, lo que garantiza una precisión dentro de ±30 % del valor nominal del 5 %.
El estándar incluye marcadores integrados para monitorear variables preanalíticas como la degradación del ADN y la inhibición de la PCR, lo que permite a los laboratorios identificar ineficiencias en el flujo de trabajo que pueden comprometer la sensibilidad de la detección de mutaciones.
Almacene las secciones a -25 °C ~ -15 °C hasta su uso y evite la exposición prolongada a las condiciones ambientales. Utilice pinzas estériles para transferir secciones a tubos de extracción para evitar la contaminación y preservar la integridad del ADN.
Procese las secciones utilizando el protocolo de extracción de ADN FFPE estándar de su laboratorio, con modificaciones según sea necesario para maximizar la recuperación del material de bajo aporte. Recomendamos utilizar kits de extracción específicamente formulados para muestras FFPE para abordar los problemas de entrecruzamiento.
Utilice el estándar para:
• Determinar el límite de detección de mutaciones KRAS en muestras FFPE
• Validar el rendimiento del ensayo en diferentes turnos de operador
• Compare la eficiencia de extracción de varios kits comerciales
• Optimice la preparación de la biblioteca NGS para ADN FFPE de bajo insumo
Cada sección de 4 μm normalmente produce entre 100 y 200 ng de ADN cuando se utilizan protocolos de extracción optimizados, lo que es suficiente para 2 o 3 reacciones de qPCR o una única preparación de biblioteca NGS.
Absolutamente. La frecuencia alélica del 5 % calibrada con precisión lo hace ideal para validar flujos de trabajo de ddPCR, incluida la determinación de la precisión, la linealidad y el sesgo del ensayo en todo el rango clínicamente relevante.
El perfil de mutación conocido del estándar permite a los laboratorios verificar que sus paneles NGS puedan detectar de manera confiable mutaciones de KRAS de baja frecuencia en medio de antecedentes de tipo salvaje, una característica de rendimiento crítica para las pruebas oncológicas.
Cat.No. |
Nombre |
Formato |
Grosor de la rebanada |
Tamaño de la unidad |
Uso previsto |
Almacenamiento |
Expiración |
CBPS0001FC-5% |
Sección FFPE del estándar de referencia KRAS p.G13D 5% |
Sección FFPE |
4 μm | 1 Sección FFPE |
Sólo para uso en investigación | -25℃~-15℃ | 36 meses |
CBPS0002FC-5% |
Sección FFPE del estándar de referencia KRAS p.G12A 5% |
Sección FFPE |
4µm |
1 Sección FFPE |
Sólo para uso en investigación |
-25℃~-15℃ |
36 meses |
CBPS0003FC-5% |
Sección FFPE del estándar de referencia KRAS p.G12C 5% |
Sección FFPE |
4µm | 1 Sección FFPE |
Sólo para uso en investigación | -25℃~-15℃ | 36 meses |
CBPS0004FC-5% |
Sección FFPE de KRAS p.A146T Estándar de referencia al 5%1 |
Sección FFPE |
4µm |
1 Sección FFPE |
Sólo para uso en investigación |
-25℃~-15℃ |
36 meses |
CBPS0005FC-5% |
Sección FFPE del estándar de referencia KRAS p.G12R 5% |
Sección FFPE |
4µm | 1 Sección FFPE |
Sólo para uso en investigación | -25℃~-15℃ | 36 meses |
CBPS0006FC-5% |
Sección FFPE del estándar de referencia KRAS p.G12D 5% |
Sección FFPE |
4µm |
1 Sección FFPE |
Sólo para uso en investigación |
-25℃~-15℃ |
36 meses |
CBPS0007FC-5% |
Sección FFPE del estándar de referencia KRAS p.G12V 5% |
Sección FFPE |
4µm | 1 Sección FFPE |
Sólo para uso en investigación | -25℃~-15℃ | 36 meses |
CBPS0008FC-5% |
Sección FFPE del estándar de referencia KRAS p.G12S 5% |
Sección FFPE |
4µm |
1 Sección FFPE |
Sólo para uso en investigación |
-25℃~-15℃ |
36 meses |
| CBPS0009FC-5% | Sección FFPE del estándar de referencia KRAS p.Q61H 5% | Sección FFPE | 4µm | 1 Sección FFPE |
Sólo para uso en investigación | -25℃~-15℃ | 36 meses |
Datos técnicos
Cat.No. |
Nombre |
Cambio de ADN |
Cambio AA |
cigosidad |
Frecuencia alélica |
Transcripción | Identificación cósmica |
Posición del motor (GRCh37) |
CBPS0001FC-5% |
Sección FFPE del estándar de referencia KRAS p.G13D 5% |
c.38G>A |
p.G13D | heterocigoto |
5% | ENST00000311936 | COSM532 | chr12:25398281 |
CBPS0002FC-5% |
Sección FFPE del estándar de referencia KRAS p.G12A 5% |
c.35G>C |
p.G12A |
heterocigoto |
5% |
ENST00000311936 | COSM522 |
chr12:25398284 |
CBPS0003FC-5% |
Sección FFPE del estándar de referencia KRAS p.G12C 5% |
c.34G>T |
p.G12C | heterocigoto |
5% | ENST00000311936 | COSM516 | chr12:25398285 |
CBPS0004FC-5% |
Sección FFPE de KRAS p.A146T Estándar de referencia al 5%1 |
c.436G>A |
p.A146T |
heterocigoto |
5% |
NM_033360.4 | COSM19404 |
chr12:25378562 |
CBPS0005FC-5% |
Sección FFPE del estándar de referencia KRAS p.G12R 5% |
c.34G>C |
p.G12R | heterocigoto | 5% | ENST00000311936 | COSM518 | chr12:25398285 |
CBPS0006FC-5% |
Sección FFPE del estándar de referencia KRAS p.G12D 5% |
c.35G>A |
p.G12D |
heterocigoto |
5% |
ENST00000311936 | COSM521 |
chr12:25398284 |
CBPS0007FC-5% |
Sección FFPE del estándar de referencia KRAS p.G12V 5% |
c.35G>T |
p.G12V | heterocigoto | 5% | ENST00000311936 | COSM520 | chr12:25398284 |
CBPS0008FC-5% |
Sección FFPE del estándar de referencia KRAS p.G12S 5% |
c.34G>A |
p.G12S |
heterocigoto |
5% |
ENST00000311936 | COSM517 |
chr12:25398285 |
| CBPS0009FC-5% | Sección FFPE del estándar de referencia KRAS p.Q61H 5% | c.183A>T | p.Q61H | heterocigoto | 5% | ENST00000311936 | COSM555 | chr12:25380275 |
información general
Cat.No. |
Nombre |
Formato |
Grosor de la rebanada |
Tamaño de la unidad |
Uso previsto |
Almacenamiento |
Expiración |
CBPS0001FC-5% |
Sección FFPE del estándar de referencia KRAS p.G13D 5% |
Sección FFPE |
4 μm | 1 Sección FFPE |
Sólo para uso en investigación | -25℃~-15℃ | 36 meses |
CBPS0002FC-5% |
Sección FFPE del estándar de referencia KRAS p.G12A 5% |
Sección FFPE |
4µm |
1 Sección FFPE |
Sólo para uso en investigación |
-25℃~-15℃ |
36 meses |
CBPS0003FC-5% |
Sección FFPE del estándar de referencia KRAS p.G12C 5% |
Sección FFPE |
4µm | 1 Sección FFPE |
Sólo para uso en investigación | -25℃~-15℃ | 36 meses |
CBPS0004FC-5% |
Sección FFPE de KRAS p.A146T Estándar de referencia al 5%1 |
Sección FFPE |
4µm |
1 Sección FFPE |
Sólo para uso en investigación |
-25℃~-15℃ |
36 meses |
CBPS0005FC-5% |
Sección FFPE del estándar de referencia KRAS p.G12R 5% |
Sección FFPE |
4µm | 1 Sección FFPE |
Sólo para uso en investigación | -25℃~-15℃ | 36 meses |
CBPS0006FC-5% |
Sección FFPE del estándar de referencia KRAS p.G12D 5% |
Sección FFPE |
4µm |
1 Sección FFPE |
Sólo para uso en investigación |
-25℃~-15℃ |
36 meses |
CBPS0007FC-5% |
Sección FFPE del estándar de referencia KRAS p.G12V 5% |
Sección FFPE |
4µm | 1 Sección FFPE |
Sólo para uso en investigación | -25℃~-15℃ | 36 meses |
CBPS0008FC-5% |
Sección FFPE del estándar de referencia KRAS p.G12S 5% |
Sección FFPE |
4µm |
1 Sección FFPE |
Sólo para uso en investigación |
-25℃~-15℃ |
36 meses |
| CBPS0009FC-5% | Sección FFPE del estándar de referencia KRAS p.Q61H 5% | Sección FFPE | 4µm | 1 Sección FFPE |
Sólo para uso en investigación | -25℃~-15℃ | 36 meses |
Datos técnicos
Cat.No. |
Nombre |
Cambio de ADN |
Cambio AA |
cigosidad |
Frecuencia alélica |
Transcripción | Identificación cósmica |
Posición del motor (GRCh37) |
CBPS0001FC-5% |
Sección FFPE del estándar de referencia KRAS p.G13D 5% |
c.38G>A |
p.G13D | heterocigoto |
5% | ENST00000311936 | COSM532 | chr12:25398281 |
CBPS0002FC-5% |
Sección FFPE del estándar de referencia KRAS p.G12A 5% |
c.35G>C |
p.G12A |
heterocigoto |
5% |
ENST00000311936 | COSM522 |
chr12:25398284 |
CBPS0003FC-5% |
Sección FFPE del estándar de referencia KRAS p.G12C 5% |
c.34G>T |
p.G12C | heterocigoto |
5% | ENST00000311936 | COSM516 | chr12:25398285 |
CBPS0004FC-5% |
Sección FFPE de KRAS p.A146T Estándar de referencia al 5%1 |
c.436G>A |
p.A146T |
heterocigoto |
5% |
NM_033360.4 | COSM19404 |
chr12:25378562 |
CBPS0005FC-5% |
Sección FFPE del estándar de referencia KRAS p.G12R 5% |
c.34G>C |
p.G12R | heterocigoto | 5% | ENST00000311936 | COSM518 | chr12:25398285 |
CBPS0006FC-5% |
Sección FFPE del estándar de referencia KRAS p.G12D 5% |
c.35G>A |
p.G12D |
heterocigoto |
5% |
ENST00000311936 | COSM521 |
chr12:25398284 |
CBPS0007FC-5% |
Sección FFPE del estándar de referencia KRAS p.G12V 5% |
c.35G>T |
p.G12V | heterocigoto | 5% | ENST00000311936 | COSM520 | chr12:25398284 |
CBPS0008FC-5% |
Sección FFPE del estándar de referencia KRAS p.G12S 5% |
c.34G>A |
p.G12S |
heterocigoto |
5% |
ENST00000311936 | COSM517 |
chr12:25398285 |
| CBPS0009FC-5% | Sección FFPE del estándar de referencia KRAS p.Q61H 5% | c.183A>T | p.Q61H | heterocigoto | 5% | ENST00000311936 | COSM555 | chr12:25380275 |