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Referencia del sitio de integración múltiple policlonal de lentivirus: 5%

Los vectores lentivirales (LV) están modificados a partir del virus de la inmunodeficiencia humana VIH-1. Pueden transferir una gran cantidad de información genética a las células huésped e integrarse en el genoma celular, lo que permite que se exprese de manera estable en la célula durante varias generaciones. Al mismo tiempo, como se han eliminado sus genes de virulencia, puede utilizarse con seguridad en el laboratorio como pseudovirus. Los vectores lentivirales pueden transfectar una variedad de células, incluidas células primarias y otras células difíciles de transfectar.

Modelo:
CBPL0007
Número de catálogo:
CBPL0007

Disponibilidad:

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Descripción

Este producto cubre 20 sitios de inserción, provenientes de 20 genes en 11 cromosomas diferentes, con una frecuencia de integración del 5%.

Mediante la tecnología NGS (secuenciación de sonda de captura), combinada con métodos de análisis bioinformático, se seleccionaron genes con más de 1000 lecturas para la verificación de Sanger y ddPCR, y la frecuencia de integración se detectó mediante ddPCR. Se combinaron múltiples métodos para localizar con precisión el sitio de inserción y la frecuencia de integración del lentivirus.

información general

Nombre	Referencia del sitio de integración múltiple policlonal de lentivirus: 5%
Gato. No.	CBPL0007
Formato	ADN genómico
Tamaño	1ug
Condiciones de almacenamiento	2~8℃
Expiración	36 meses desde la fecha de fabricación.

de detecciónMétodos

Actualmente, la principal plataforma para detectar sitios de integración lentivirales es la secuenciación de alta profundidad (NGS).

Métodos	Características
nrLAM-PCR	1. Enlazador monocatenario, baja eficiencia de conexión 2. Proceso complejo, alto costo 3. No es necesario interrumpir el genoma.
LAM-PCR	1. Enlazador monocatenario, baja eficiencia de conexión 2. Proceso complejo, alto costo 3. La digestión enzimática se utiliza para la interrupción del genoma, que tiene preferencia de reconocimiento de sitios, introducirá errores técnicos y tiene ciertas limitaciones para identificar todos los sitios de inserción.
Secuenciación del genoma completo (WGS）	1. Requiere una gran cantidad de datos y un alto coste de secuenciación. 2. No es necesario diseñar cebadores
PCR-LM	1. Interrupción física aleatoria ultrasónica, sin preferencia 2. Comparado con el método WGS, no requiere una gran cantidad de datos. 3. Enlazador bicatenario, alta eficiencia de conexión
LTA-PCR	1. Método probado de detección de ISA 2. Tiene un excelente rendimiento de detección en muchos vectores vral.

Después de una consideración exhaustiva, CB-Gene seleccionó múltiples métodos (secuenciación de sonda de captura + sanger + ddPCR) para verificar completamente la precisión del estándar. Durante el proceso de verificación, se verificó bien la precisión de la tecnología de secuenciación de sondas de captura para la detección del sitio de integración lentiviral.

Ⅳ .Sitios de integración (hg19)

Ubicación cromosómica	Ubicación del punto de interrupción	Gene	Frecuencia
chr2	128744988	SAP130	5%
chr2	213888416	IKZF2	5%
chr3	4871944	ITPR1	5%
chr3	43344305	SNRK	5%
chr4	288630	ZNF732	5%
chr4	16184544	TAP1	5%
chr6	74230646	EEF1A1	5%
chr8	145512905	BOP1	5%
chr8	145523573	HSF1	5%
chr9	130845722	SLC25A25	5%
chr9	33997906	UBAP2	5%
chr9	131719784	NUP188	5%
chr9	115151308	HSDL2	5%
chr9	139798150	TRAF2	5%
chr16	47285195	ITFG1	5%
chr17	18494286	CCDC144B	5%
chr19	56328752	NLRP11	5%
chr19	55914181	UBE2S	5%
chr22	50808061	PPP6R2	5%
chrX	38435241	TSPAN7	5%

Ⅴ.Datos Representativos

Presentación de caso - 5% chr3: 4871944 ITPR1 Cuatro resultados de prueba:

PCR-LM:

NGS:

NGS

Sanger:

3'LTR+ITPR1 chr3_4871940

ITPR1-chr3_4871944+5LTR

ITPR1 chr3_4871944+5'LTR

DPCR:

DPCR

Ⅵ.Lista de productos relacionados

Producto	de catálogo Número	Descripción	Detalles
Estándar de referencia del sitio de integración de vectores lentivirales	CBPL0002	Contiene múltiples sitios de inserción.	Estándar de referencia del sitio de integración de vectores lentivirales CBPL0002.pdf
Estándar de referencia del sitio de integración de vectores lentivirales III (sitio único)	CBPL0004	Contiene un sitio de inserción	Estándar de referencia del sitio de integración de vectores lentivirales III (sitio único) CBPL0004.pdf
Estándar de referencia del sitio de integración de vectores lentivirales II (sitio único)	CBPL0003	Contiene un sitio de inserción	Estándar de referencia del sitio de integración de vectores lentivirales II (sitio único) CBPL0003.pdf
Reactivo de referencia IV para análisis del sitio de integración lentiviral (contiene inserción de cromosoma sexual)	CBPL0005	incluyendo un sitio de cromosoma sexual	Reactivo de referencia IV para análisis del sitio de integración lentiviral (contiene inserción de cromosoma sexual) CBPL0005.pdf
Reactivo de referencia negativo para análisis del sitio de integración de lentivirus	CBPL0006	control negativo
Referencia del sitio de integración múltiple policlonal de lentivirus: 2%	CBPL0008	Cubriendo 20 sitios de inserción	Referencia del sitio de integración múltiple policlonal de lentivirus - 2% CBPL0008.pdf

de detecciónMétodos

Actualmente, la principal plataforma para detectar sitios de integración lentivirales es la secuenciación de alta profundidad (NGS).

Métodos	Características
nrLAM-PCR	1. Enlazador monocatenario, baja eficiencia de conexión 2. Proceso complejo, alto costo 3. No es necesario interrumpir el genoma.
LAM-PCR	1. Enlazador monocatenario, baja eficiencia de conexión 2. Proceso complejo, alto costo 3. La digestión enzimática se utiliza para la interrupción del genoma, que tiene preferencia de reconocimiento de sitios, introducirá errores técnicos y tiene ciertas limitaciones para identificar todos los sitios de inserción.
Secuenciación del genoma completo (WGS）	1. Requiere una gran cantidad de datos y un alto coste de secuenciación. 2. No es necesario diseñar cebadores
PCR-LM	1. Interrupción física aleatoria ultrasónica, sin preferencia 2. Comparado con el método WGS, no requiere una gran cantidad de datos. 3. Enlazador bicatenario, alta eficiencia de conexión
LTA-PCR	1. Método probado de detección de ISA 2. Tiene un excelente rendimiento de detección en muchos vectores vral.

Ⅳ .Sitios de integración (hg19)

Ubicación cromosómica	Ubicación del punto de interrupción	Gene	Frecuencia
chr2	128744988	SAP130	5%
chr2	213888416	IKZF2	5%
chr3	4871944	ITPR1	5%
chr3	43344305	SNRK	5%
chr4	288630	ZNF732	5%
chr4	16184544	TAP1	5%
chr6	74230646	EEF1A1	5%
chr8	145512905	BOP1	5%
chr8	145523573	HSF1	5%
chr9	130845722	SLC25A25	5%
chr9	33997906	UBAP2	5%
chr9	131719784	NUP188	5%
chr9	115151308	HSDL2	5%
chr9	139798150	TRAF2	5%
chr16	47285195	ITFG1	5%
chr17	18494286	CCDC144B	5%
chr19	56328752	NLRP11	5%
chr19	55914181	UBE2S	5%
chr22	50808061	PPP6R2	5%
chrX	38435241	TSPAN7	5%

Productos calientes

Estándar de referencia Plus AI-Edigene® EGFR p.T790M

Número de material: CBP10402

Tamaño: 1ug

AI-Edigene® BRAF p.K601E Estándar de referencia Plus

Número de material: CBP10428

Tamaño: 1ug

AI-Edigene® c-KIT p.D816V Estándar de referencia Plus

Número de material: CBP10402

Tamaño: 1ug

Referencia del sitio de integración múltiple policlonal de lentivirus: 5%

Estándar de referencia Plus AI-Edigene® EGFR p.T790M

AI-Edigene® BRAF p.K601E Estándar de referencia Plus

AI-Edigene® c-KIT p.D816V Estándar de referencia Plus

Enlaces rápidos

Categoría de producto

Producto	de catálogoNúmero	Descripción	Detalles
Estándar de referencia del sitio de integración de vectores lentivirales	CBPL0002	Contiene múltiples sitios de inserción.	Estándar de referencia del sitio de integración de vectores lentivirales CBPL0002.pdf
Estándar de referencia del sitio de integración de vectores lentivirales III (sitio único)	CBPL0004	Contiene un sitio de inserción	Estándar de referencia del sitio de integración de vectores lentivirales III (sitio único) CBPL0004.pdf
Estándar de referencia del sitio de integración de vectores lentivirales II (sitio único)	CBPL0003	Contiene un sitio de inserción	Estándar de referencia del sitio de integración de vectores lentivirales II (sitio único) CBPL0003.pdf
Reactivo de referencia IV para análisis del sitio de integración lentiviral (contiene inserción de cromosoma sexual)	CBPL0005	incluyendo un sitio de cromosoma sexual	Reactivo de referencia IV para análisis del sitio de integración lentiviral (contiene inserción de cromosoma sexual) CBPL0005.pdf
Reactivo de referencia negativo para análisis del sitio de integración de lentivirus	CBPL0006	control negativo
Referencia del sitio de integración múltiple policlonal de lentivirus: 2%	CBPL0008	Cubriendo 20 sitios de inserción	Referencia del sitio de integración múltiple policlonal de lentivirus - 2% CBPL0008.pdf