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विवरण
यह उत्पाद 20 सम्मिलन साइटों को कवर करता है, जो 11 विभिन्न गुणसूत्रों पर 20 जीनों से आते हैं, 5% की एकीकरण आवृत्ति के साथ।
एनजीएस (कैप्चर प्रोब सीक्वेंसिंग) तकनीक के माध्यम से, जैव सूचना विज्ञान विश्लेषण विधियों के साथ संयुक्त, 1000× से अधिक रीड वाले जीन को सेंगर और डीडीपीसीआर सत्यापन के लिए चुना गया था, और डीडीपीसीआर द्वारा एकीकरण आवृत्ति का पता लगाया गया था। लेंटवायरस के सम्मिलन स्थल और एकीकरण आवृत्ति का सटीक पता लगाने के लिए कई तरीकों को जोड़ा गया था।
सामान्य जानकारी
नाम |
लेंटवायरस पॉलीक्लोनल मल्टी-इंटीग्रेशन साइट संदर्भ - 5% |
बिल्ली। नहीं। |
सीबीपीएल0007 |
प्रारूप |
जीनोमिक डीएनए |
आकार |
1ug |
जमा करने की अवस्था |
2~8℃ |
समाप्ति |
निर्माण की तारीख से 36 महीने |
डी पता लगाने के तरीके
वर्तमान में, लेंटीवायरल एकीकरण साइटों का पता लगाने का मुख्य मंच उच्च-गहराई अनुक्रमण (एनजीएस) है।
| तरीकों | विशेषताएँ |
| एनआरएलएएम-पीसीआर | 1. सिंगल-स्ट्रैंडेड लिंकर, कम कनेक्शन क्षमता 2. जटिल प्रक्रिया, उच्च लागत 3. जीनोम को बाधित करने की कोई आवश्यकता नहीं है |
| एलएएम-पीसीआर | 1. सिंगल-स्ट्रैंडेड लिंकर, कम कनेक्शन क्षमता 2. जटिल प्रक्रिया, उच्च लागत 3. एंजाइम पाचन का उपयोग जीनोम रुकावट के लिए किया जाता है, जिसमें साइट पहचान प्राथमिकता होती है, तकनीकी त्रुटियां पेश की जाएंगी, और सभी प्रविष्टि साइटों की पहचान करने के लिए कुछ सीमाएं हैं |
संपूर्ण जीनोम अनुक्रमण (WGS) |
1. बड़ी मात्रा में डेटा, उच्च अनुक्रमण लागत की आवश्यकता होती है 2. प्राइमर डिज़ाइन करने की कोई ज़रूरत नहीं |
| एल एम पीसीआर | 1. अल्ट्रासोनिक भौतिक यादृच्छिक रुकावट, कोई प्राथमिकता नहीं 2. WGS विधि की तुलना में, इसमें बड़ी मात्रा में डेटा की आवश्यकता नहीं होती है 3. डबल-स्ट्रैंडेड लिंकर, उच्च कनेक्शन दक्षता |
| एलटीए-पीसीआर | 1. सिद्ध आईएसए पता लगाने की विधि 2. कई वीआरएल वैक्टर में उत्कृष्ट पहचान प्रदर्शन है |
व्यापक विचार-विमर्श के बाद, सीबी-जीन ने मानक की सटीकता को पूरी तरह से सत्यापित करने के लिए सत्यापन के लिए कई तरीकों (कैप्चर जांच अनुक्रम + सेंगर + डीडीपीसीआर) का चयन किया। सत्यापन प्रक्रिया के दौरान, लेंटीवायरल एकीकरण साइट का पता लगाने के लिए कैप्चर जांच अनुक्रमण तकनीक की सटीकता को अच्छी तरह से सत्यापित किया गया था।
Ⅳ .एकीकरण साइटें(hg19)
गुणसूत्र स्थान |
ब्रेकप्वाइंट स्थान |
जीन |
आवृत्ति |
chr2 |
128744988 |
एसएपी130 |
5% |
chr2 |
213888416 |
IKZF2 |
5% |
chr3 |
4871944 |
आईटीपीआर1 |
5% |
chr3 |
43344305 |
एसएनआरके |
5% |
chr4 |
288630 |
ZNF732 |
5% |
chr4 |
16184544 |
TAPT1 |
5% |
chr6 |
74230646 |
EEF1A1 |
5% |
chr8 |
145512905 |
बीओपी1 |
5% |
chr8 |
145523573 |
एचएसएफ1 |
5% |
chr9 |
130845722 |
एसएलसी25ए25 |
5% |
chr9 |
33997906 |
UBAP2 |
5% |
chr9 |
131719784 |
एनयूपी188 |
5% |
chr9 |
115151308 |
एचएसडीएल2 |
5% |
chr9 |
139798150 |
TRAF2 |
5% |
chr16 |
47285195 |
आईटीएफजी1 |
5% |
chr17 |
18494286 |
सीसीडीसी144बी |
5% |
chr19 |
56328752 |
एनएलआरपी11 |
5% |
chr19 |
55914181 |
UBE2S |
5% |
chr22 |
50808061 |
PPP6R2 |
5% |
chrX |
38435241 |
टीएसपीएएन7 |
5% |
Ⅴ.प्रतिनिधि डेटा
केस प्रस्तुति - 5% chr3: 4871944 ITPR1 चार परीक्षण परिणाम:
एलएम-पीसीआर:
एनजीएस:
सेंगर:
3'LTR+ITPR1 chr3_4871940 |
ITPR1 chr3_4871944+5'LTR |
डीपीसीआर:
Ⅵ.संबंधित उत्पाद सूची
उत्पाद |
कैटलॉग संख्या |
विवरण |
विवरण |
लेंटीवायरल वेक्टर एकीकरण साइट संदर्भ मानक |
सीबीपीएल0002 |
एकाधिक प्रविष्टि साइटें शामिल हैं |
|
लेंटीवायरल वेक्टर एकीकरण साइट संदर्भ मानक III (एकल साइट) |
सीबीपीएल0004 |
इसमें एक प्रविष्टि साइट शामिल है |
|
लेंटीवायरल वेक्टर एकीकरण साइट संदर्भ मानक II (एकल साइट) |
सीबीपीएल0003 |
इसमें एक प्रविष्टि साइट शामिल है |
|
लेंटीवायरल इंटीग्रेशन साइट विश्लेषण संदर्भ अभिकर्मक IV (सेक्स क्रोमोसोम सम्मिलन शामिल है) |
सीबीपीएल0005 |
जिसमें एक लिंग गुणसूत्र स्थल भी शामिल है |
|
लेंटवायरस एकीकरण साइट विश्लेषण नकारात्मक संदर्भ अभिकर्मक |
सीबीपीएल0006 |
नकारात्मक नियंत्रण |
|
लेंटवायरस पॉलीक्लोनल मल्टी-इंटीग्रेशन साइट संदर्भ - 2% |
सीबीपीएल0008 |
20 प्रविष्टि साइटों को कवर करना |
|
