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अगली पीढ़ी अनुक्रमण (एनजीएस)

WES-नियमित

संपूर्ण एक्सोम मानव जीनोम में सभी प्रोटीन-कोडिंग क्षेत्रों (यानी, एक्सॉन) के संग्रह को संदर्भित करता है। हालाँकि एक्सॉन पूरे जीनोम का लगभग 1%-2% ही बनाते हैं, लगभग 85% ज्ञात रोग-संबंधी आनुवंशिक वैरिएंट इसी क्षेत्र में पाए जाते हैं।
डब्ल्यूईएस-रूटीन परीक्षण, जिसे नियमित संपूर्ण एक्सोम परीक्षण के रूप में भी जाना जाता है, किसी व्यक्ति के जीनोम में सभी एक्सॉन क्षेत्रों के बड़े पैमाने पर, समानांतर अनुक्रमण करने के लिए उच्च-थ्रूपुट अनुक्रमण तकनीक का उपयोग करता है। इसका मुख्य उद्देश्य आनुवंशिक रोगों, कैंसर, दवा प्रतिक्रिया और अन्य स्थितियों से जुड़े आनुवंशिक वेरिएंट की त्वरित और सटीक पहचान करना है, रोग निदान, रोकथाम और उपचार के लिए सटीक आनुवंशिक प्रमाण प्रदान करना है।

टीएमबी(डब्ल्यूईएस)

ट्यूमर उत्परिवर्तन बोझ (टीएमबी) एक ट्यूमर जीनोम में प्रति मिलियन आधार जोड़े में दैहिक जीन उत्परिवर्तन (बिंदु उत्परिवर्तन, सम्मिलन / विलोपन, आदि सहित) की कुल संख्या को संदर्भित करता है। यह ट्यूमर कोशिकाओं में उत्परिवर्तन की डिग्री निर्धारित करता है।

सीधे शब्दों में कहें तो, उच्च टीएमबी ट्यूमर कोशिकाओं द्वारा उत्पादित असामान्य प्रोटीन (नियोएंटीजन) की अधिक संख्या को इंगित करता है। इन नवजात प्रतिजनों को शरीर की अपनी प्रतिरक्षा प्रणाली (टी कोशिकाओं) द्वारा 'विदेशी' के रूप में पहचाने जाने की अधिक संभावना है, जिससे अधिक मजबूत प्रतिरक्षा हमला शुरू हो जाता है। जब प्रतिरक्षा कोशिकाओं के ट्यूमर दमन को दूर करने के लिए पीडी-1/पीडी-एल1 अवरोधक जैसे इम्यूनोथेरेपी का उपयोग किया जाता है, तो उच्च टीएमबी ट्यूमर वाले रोगियों को अनुकूल उपचार परिणाम और टिकाऊ नैदानिक ​​​​प्रतिक्रियाएं प्राप्त होने की अधिक संभावना होती है।

एमएसआई (पैनल)

माइक्रोसैटेलाइट अस्थिरता (एमएसआई) एक ऐसी घटना को संदर्भित करती है जिसमें डीएनए बेमेल मरम्मत (एमएमआर) प्रणाली में दोषों के कारण कोशिका विभाजन के दौरान माइक्रोसैटेलाइट की लंबाई बदल जाती है। माइक्रोसैटेलाइट्स लघु अग्रानुक्रम दोहराव (आमतौर पर 1-6 आधार जोड़े) होते हैं जो पूरे जीनोम में सर्वव्यापी होते हैं। आम तौर पर, डीएनए प्रतिकृति के दौरान त्रुटियों को एमएमआर प्रणाली द्वारा तुरंत ठीक किया जाता है। हालाँकि, जब MMR जीन (जैसे MLH1, MSH2, MSH6 और PMS2) उत्परिवर्तित या मौन हो जाते हैं, तो त्रुटियाँ जमा हो जाती हैं, जिससे माइक्रोसैटेलाइट लंबाई और MSI फेनोटाइप में भिन्नता होती है।

एनआईपीटी (एनजीएस)

पारंपरिक इनवेसिव प्रीनेटल डायग्नोस्टिक तकनीकों (जैसे एमनियोसेंटेसिस और कोरियोनिक विलस सैंपलिंग) की तुलना में, एनआईपीटी को केवल 10 एमएल मातृ शिरापरक रक्त की आवश्यकता होती है, जो प्रक्रिया से जुड़े अंतर्गर्भाशयी संक्रमण और गर्भपात के जोखिमों (लगभग 0.5-1% के जोखिम के साथ) से पूरी तरह से बचाता है। इसलिए, यह गर्भवती महिलाओं द्वारा अधिक आसानी से स्वीकार किया जाता है और गैर-आक्रामक, सुरक्षित और शून्य गर्भपात जोखिम जैसे महत्वपूर्ण लाभ प्रदान करता है। यह दुनिया भर में व्यापक रूप से इस्तेमाल किया जाने वाला प्रथम-पंक्ति प्रसव पूर्व जांच विकल्प बन गया है।

एचएलए (एनजीएस)

एनजीएस-एचएलए टाइपिंग पूरे एचएलए जीन को अनुक्रमित करने के लिए उच्च-थ्रूपुट अनुक्रमण तकनीक का उपयोग करती है, जिससे उच्च-रिज़ॉल्यूशन और उच्च-सटीकता टाइपिंग प्राप्त होती है। पारंपरिक तरीकों (जैसे पीसीआर-एसएसओ, पीसीआर-एसएसपी और सेंगर अनुक्रमण) की तुलना में, एनजीएस पूरे एचएलए जीन क्षेत्र को कवर कर सकता है, जिसमें एक्सॉन, इंट्रॉन और अनट्रांसलेटेड क्षेत्र शामिल हैं, जो अधिक व्यापक आनुवंशिक जानकारी प्रदान करते हैं।

सेल प्रमाणीकरण (एनजीएस)

एनजीएस सेल प्रमाणीकरण सेवाएँ सेल नमूने के संपूर्ण जीनोम या लक्षित क्षेत्रों की गहरी अनुक्रमण करने के लिए उच्च-थ्रूपुट अनुक्रमण तकनीक का उपयोग करती हैं। अनुक्रम जानकारी की तुलना और विश्लेषण करके, एनजीएस कोशिका प्रजातियों, उत्पत्ति की प्रजातियों और ऊतक प्रकार की सटीक पहचान के साथ-साथ माइक्रोबियल संदूषण (जैसे माइकोप्लाज्मा) का पता लगाने में सक्षम बनाता है। यह न केवल पुष्टि करता है कि कोई कोशिका अपेक्षित प्रकार की है, बल्कि गहरे स्तर पर इसकी अद्वितीय आनुवंशिक पृष्ठभूमि और स्थिरता को भी प्रकट करती है, जो 'आनुवंशिक आईडी कार्ड' के रूप में कार्य करती है जो प्रयोगात्मक डेटा और उत्पादन सुरक्षा की विश्वसनीयता सुनिश्चित करती है।

मोनोक्लोनेलिटी विश्लेषण

सटीक चिकित्सा के युग में, मोनोक्लोनैलिटी विश्लेषण हेमटोलोगिक मैलिग्नेंसी निदान, चिकित्सीय प्रभावकारिता निगरानी और इम्यूनोलॉजी अनुसंधान के लिए एक मुख्य उपकरण बन गया है। अगली पीढ़ी की अनुक्रमण (एनजीएस) तकनीक की परिपक्वता के साथ, एनजीएस-आधारित मोनोक्लोनैलिटी विश्लेषण सेवाएं धीरे-धीरे पारंपरिक तरीकों की जगह ले रही हैं। अपनी अभूतपूर्व संवेदनशीलता, मात्रात्मक क्षमताओं और उच्च थ्रूपुट के साथ, वे नैदानिक ​​और वैज्ञानिक अनुसंधान के लिए मजबूत तकनीकी सहायता प्रदान करते हैं। यह आलेख एनजीएस-आधारित मोनोक्लोनैलिटी विश्लेषण के कार्य सिद्धांतों, मानकीकृत वर्कफ़्लो और व्यापक अनुप्रयोग परिदृश्यों का गहन विश्लेषण प्रदान करेगा।

स्थिरता विश्लेषण

अगली पीढ़ी की अनुक्रमण (एनजीएस) तकनीक आधुनिक जीवन विज्ञान और चिकित्सा अनुसंधान में एक मुख्य उपकरण बन गई है, जिसका व्यापक रूप से जीनोमिक्स, ट्रांसक्रिप्टोमिक्स और एपिजेनेटिक्स जैसे क्षेत्रों में उपयोग किया जाता है। हालाँकि, एनजीएस डेटा का निर्माण जटिल और बहु-चरणीय है, और इसके परिणामों की स्थिरता और विश्वसनीयता सीधे वैज्ञानिक निष्कर्षों की सटीकता को प्रभावित करती है। इसलिए, एनजीएस प्रौद्योगिकी का व्यवस्थित स्थिरता विश्लेषण महत्वपूर्ण है। यह लेख चार दृष्टिकोणों से एनजीएस प्रौद्योगिकी के स्थिरता विश्लेषण का पता लगाएगा: सिद्धांत, वर्कफ़्लो, विश्लेषण चक्र और अनुप्रयोग परिदृश्य।
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