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एफएलपी-एफआरटी साइट-विशिष्ट एकीकरण प्रणाली

परिभाषा

एफएलपी : एफएलपी (फ्लिपपेज़) रीकॉम्बिनेज़ यीस्ट से प्राप्त एक साइट-विशिष्ट पुनर्संयोजन एंजाइम है। एफएलपी जीन की लंबाई लगभग 1272 बीपी है और यह लगभग 48 केडीए के आणविक भार के साथ 423-अमीनो-एसिड पॉलीपेप्टाइड को एनकोड करता है। Flp एक मोनोमर के रूप में कार्य करता है।

एफआरटी: एफआरटी (एफएलपी पुनर्संयोजन लक्ष्य) एफएलपी पुनर्संयोजन द्वारा मान्यता प्राप्त विशिष्ट डीएनए अनुक्रम है। एफआरटी साइट की लंबाई 48 बीपी है और इसमें दो 13-बीपी उल्टे रिपीट होते हैं, जो 8-बीपी असममित स्पेसर के साथ-साथ अतिरिक्त 13-बीपी रिपीट को फ़्लैंक करते हैं। उल्टे दोहराव एफएलपी बाइंडिंग साइट के रूप में काम करते हैं, जबकि स्पेसर क्षेत्र पुनर्संयोजन साइट को परिभाषित करता है और पुनर्संयोजन घटना को दिशा प्रदान करता है।
 
 
 
 

एफएलपी-एफआरटी साइट-निर्देशित एकीकरण प्रणाली

एफएलपी-एफआरटी एकीकरण प्रणाली मेजबान जीनोम में रुचि के जीन के लक्षित सम्मिलन के साथ स्थिर सेल लाइनें उत्पन्न करने के लिए एक साइट-विशिष्ट पुनर्संयोजन दृष्टिकोण है। एफएलपी रीकॉम्बिनेज़ और परिभाषित एफआरटी साइटों का उपयोग करके, यह प्रणाली सटीक जीनोमिक एकीकरण को सक्षम करती है और निरंतर प्रोटीन उत्पादन सुनिश्चित करते हुए ट्रांसजीन की स्थिर, दीर्घकालिक अभिव्यक्ति का समर्थन करती है।
 
 
 
 

काम के सिद्धांत

1. एफएलपी-एफआरटी कोशिकाओं का निर्माण:
एफएलपी पुनर्संयोजन लक्ष्य साइट (एफआरटी) को मेजबान सेल लाइन के जीनोम में पेश किया जाता है। सामान्य संरचना एटीजी + एफआरटी + प्रतिरोध जीन है। मूल कोशिका के लिए चयनित अभिकर्मक रणनीति के आधार पर, प्रतिरोध स्क्रीनिंग के माध्यम से स्थिर कोशिका रेखाएँ उत्पन्न की जा सकती हैं।
 
सीबी-जीन का प्रश्न 1 : आमतौर पर यह माना जाता है कि इस निर्माण चरण के दौरान, एफआरटी कोशिका के ट्रांसक्रिप्शनल रूप से सक्रिय क्षेत्र में एकीकृत हो जाएगा। इसका मतलब यह है कि पुनः संयोजक बहिर्जात लक्ष्य जीन की बाद की अभिव्यक्ति के लिए, यह एकीकरण कदम बहिर्जात प्रोटीन की अतिअभिव्यक्ति के लिए एक निश्चित डिग्री का आश्वासन प्रदान करता है।
 
विशिष्ट एकीकरण स्थानों के लिए, कृपया हमारी आईएसएस (एकीकरण साइट खोज) सेवा से परामर्श लें।

सीबी-जीन का प्रश्न 2 : एक पारंपरिक प्लास्मिड ट्रांसफ़ेक्शन प्रोटोकॉल में, कितनी प्रतियों को मेजबान सेल में एकीकृत किया जा सकता है? प्रतियों की इष्टतम संख्या क्या है? सामान्यतया, एफएलपी-एफआरटी मातृ कोशिकाओं का निर्माण करते समय, अभिकर्मक के बाद एकीकरण यादृच्छिक रूप से होता है, जिसका अर्थ है कि कई प्रतियों को मेजबान कोशिका में विभिन्न गुणसूत्र स्थानों में एकीकृत किया जाएगा। जितनी अधिक प्रतियां एकीकृत होंगी, लक्ष्य जीन के पुनर्संयोजित और एकीकृत होने की संभावना उतनी ही अधिक होगी, जो उच्च अभिव्यक्ति का संकेत देता है। हालाँकि, लक्ष्य जीन को पुनर्संयोजित करते समय, एकाधिक प्रतियों की एकीकरण दक्षता 100% नहीं हो सकती है, जिसके परिणामस्वरूप मिश्रित क्लोन (क्लोन के बीच असंगत अभिव्यक्ति स्तर) होते हैं। कभी-कभी, लक्ष्य प्रोटीन के लिए जिन्हें उच्च अभिव्यक्ति की आवश्यकता नहीं होती है, केबाई एकल एकीकृत प्रतिलिपि के साथ क्लोन का चयन करने की सलाह देते हैं। इस तरह, कोई भी क्लोन जो प्रतिरोध स्क्रीनिंग से गुजरता है, सिद्धांत रूप में, एक एकल क्लोन है, जो कमजोर पड़ने वाले क्लोनिंग को सीमित करने की आवश्यकता को समाप्त करता है। 
 
कॉपी नंबर का पता लगाने के लिए, कृपया हमारी डीपीसीआर डिटेक्शन सेवा से परामर्श लें।
 

सीबी-जीन की आंतरिक स्पॉट एफएलपी-एफआरटी कोशिकाएं

 

2. लक्ष्य जीन का एकीकरण:

लक्ष्य जीन युक्त एक अभिव्यक्ति वेक्टर और एफएलपी रीकॉम्बिनेज़ युक्त अभिव्यक्ति वेक्टर को चरण 1 से कोशिकाओं में सह-ट्रांसफ़ेक्ट किया जाता है। एफएलपी रीकॉम्बिनेज़ मेजबान जीनोम और अभिव्यक्ति वेक्टर में एफआरटी साइटों के बीच साइट-विशिष्ट पुनर्संयोजन की मध्यस्थता करता है, लक्ष्य जीन के एकीकरण को प्राप्त करता है और प्रमोटर के नियंत्रण में स्थिर अभिव्यक्ति को सक्षम करता है।

 

वाहक 1:

एफएलपी रीकॉम्बिनेज़ की अत्यधिक अभिव्यक्ति, किसी प्रतिरोध की आवश्यकता नहीं, किसी स्थिर एकीकरण की आवश्यकता नहीं

 

 

वाहक 2:

इसमें लक्ष्य जीन और दूसरा प्रतिरोध जीन चयन मार्कर शामिल है

 

 

पुनर्गठन प्रक्रिया

 

 

अंतिम गठन :

पुनर्संयोजन के बाद, सकारात्मक कोशिकाओं को दूसरे प्रतिरोध जीन के माध्यम से चुना जा सकता है, और कोशिकाएं प्रतिरोध जीन -2 के प्रति सहनशील और प्रतिरोध जीन -1 के प्रति संवेदनशील होती हैं।

 

एफएलपी-एफआरटी प्रणाली के लाभ

साइट-विशिष्ट एकीकरण

यादृच्छिक गुणसूत्र स्थानों में यादृच्छिक एकीकरण को रोकना

नियंत्रणीय प्रतिलिपि संख्या

लक्ष्य जीन की प्रतिलिपि संख्या को Flp-FRT कोशिकाओं की प्रतिलिपि संख्या द्वारा नियंत्रित किया जा सकता है

स्थिर अभिव्यक्ति

यादृच्छिक एकीकरण की तुलना में, यह अभिव्यक्ति प्रणाली अधिक स्थिर है और इसे प्रतिरोध जीन 2 के साथ जांचा जा सकता है और प्रतिरोध जीन 1 के साथ सत्यापित किया जा सकता है।

उच्च अभिव्यक्ति स्तर

उच्च रीकॉम्बिनेज़ एकीकरण दक्षता, और सक्रिय ट्रांसक्रिप्शनल क्षेत्रों में एकीकरण

लघु प्रायोगिक चक्र

जीनोम की एक प्रति का चयन करने से एकल क्लोन तैयार करने के लिए कमजोर पड़ने की आवश्यकता समाप्त हो जाती है।

स्थिर सेल लाइन निर्माण सेवाएँ

सीबी-जीन 'फ्लप-एफआरटी साइट-निर्देशित एकीकरण प्रणाली' के आधार पर स्थिर सेल लाइन विकास सेवाएं प्रदान करता है। आज तक, हमने साइट-विशिष्ट जीनोम इंजीनियरिंग में व्यापक अनुभव का प्रदर्शन करते हुए, 200 से अधिक स्थिर सेल लाइन मॉडल सफलतापूर्वक तैयार किए हैं। कृपया अपनी परियोजना आवश्यकताओं पर चर्चा करने के लिए हमसे संपर्क करें।

 

 

परियोजना एफएलपी-एफआरटी सिस्टम
सेल प्रयोज्यता अंदर 4 प्रकार की कोशिकाएं
दक्षता उच्च
यादृच्छिक एकीकरण एन
जैव सुरक्षा स्तर बीएल 1
जीन पारगमन क्षमता -
चयन के बाद सकारात्मक दर उच्च
समय रेखा जीन संश्लेषण और प्लास्मिड निर्माण 4-5 सप्ताह
वायरस पैकेज -
पूल स्थिर सेल चयन 1-2 सप्ताह
मोनोक्लोनल सेल वैकल्पिक
कुल 5-7 सप्ताह
कार्यभार कम


 

 

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