Estándar dual ctDNA/gDNA TMB 22.91 para IO NGS

Descripción general del producto

El estándar Dual ctDNA/gDNA TMB 22.91 para IO NGS es un material de referencia de vanguardia diseñado para validar los flujos de trabajo de detección de carga mutacional tumoral (TMB) en aplicaciones de secuenciación de próxima generación (NGS) de inmunooncología (IO). Este estándar de referencia combina ADN genómico (ADNg) con un valor de TMB de 22,91 mutaciones/Mb calibrado con precisión , que representa el fenotipo alto de TMB clínicamente relevante asociado con la capacidad de respuesta a los inhibidores de puntos de control inmunitarios. Es el estándar de referencia TMB 22.91 de ADN tumoral libre de células (ADNct) . necesario personalizar Diseñado para imitar el complejo panorama mutacional de las muestras clínicas, este estándar aborda la necesidad crítica de controles validados que abarquen la evaluación de TMB tanto líquida como tisular, lo que permite una calibración precisa del ensayo en todo el proceso de diagnóstico IO.

Características del producto

Varias formas de productos

Los estándares de referencia de TMB están disponibles en formatos  ctDNA (fracción libre de células) y gDNA (fracción genómica) para validar los flujos de trabajo de TMB. El componente de ctDNA se somete a una fragmentación controlada a 160-180 pb , imitando la distribución de tamaño del ADN tumoral circulante en plasma, mientras que el gDNA mantiene un alto peso molecular (>20 kb) para la validación del ensayo de tejido.

Calibración TMB de precisión

El valor de 22,91 mutaciones/Mb se verifica mediante métodos ortogonales que incluyen la secuenciación del exoma completo (cobertura >500x) y la secuenciación de panel dirigida, lo que garantiza una precisión dentro de ±15 % del valor nominal. Este nivel de precisión permite una evaluación confiable de la sensibilidad del ensayo para la detección de TMB alto, un factor crítico en la selección de pacientes para inmunoterapia.

Espectro de mutación clínicamente relevante

El estándar contiene un perfil mutacional completo que incluye sustituciones, indeles y variaciones en el número de copias representativas de tumores con TMB alto. Cubre más de 1500 genes relacionados con el cáncer con tipos de mutaciones distribuidos para reflejar cohortes de inmunooncología del mundo real, incluidas mutaciones procesables en las vías asociadas a TP53, KRAS y PD-L1.

Uso

Preparación de muestras

Para la validación del flujo de trabajo de ctDNA, diluya el estándar a 10-20 ng/μL en una matriz de ADN libre de células derivada de plasma. Para aplicaciones de ADNg, utilícelo a 20-50 ng/μL en un entorno de ADN genómico normal. 

Validación del ensayo NGS

Incorpore el estándar en las ejecuciones de validación para:

• Verificar la precisión del cálculo de TMB en los paneles específicos y WES

• Establecer un límite inferior de detección de mutaciones

• Monitorear la variabilidad entre ejecuciones en la puntuación de TMB

• Validar los procesos bioinformáticos para la clasificación de variantes.

Almacenamiento y manipulación

Guarde los viales sin abrir a -80 °C hasta por 24 meses desde la fecha de fabricación. Después del primer uso, reparta alícuotas del material restante en volúmenes de un solo uso y guárdelo a -80 °C para evitar ciclos de congelación y descongelación. Descongelar en hielo durante 15 minutos antes de usar y mezclar suavemente pipeteando.

Preguntas frecuentes

¿Qué hace que este estándar sea adecuado para la investigación de IO?

El valor de 22,91 mutaciones/Mb TMB se encuentra dentro del rango alto de TMB clínicamente establecido asociado con la respuesta a los inhibidores de PD-1/PD-L1. Su diseño de matriz dual permite la validación de enfoques de biopsia líquida y de tejido comúnmente utilizados en investigaciones y pruebas clínicas de inmunooncología.

¿Cómo se calcula el TMB para este estándar?

TMB se calcula como el número total de mutaciones somáticas no sinónimas por megabase de ADN secuenciado, excluyendo las mutaciones conductoras y las variantes de la línea germinal. Esta metodología se alinea con los enfoques recomendados por la FDA para la evaluación de TMB en ensayos clínicos.

¿Se puede utilizar con paneles NGS específicos?

Sí, el estándar está optimizado para su uso con paneles de oncología comunes (50-500 genes). Incluye un factor de conversión TMB específico del panel en el certificado de análisis para permitir una comparación precisa entre diferentes tamaños y diseños de paneles.

¿El estándar contiene variantes de la línea germinal?

No, el estándar carece de polimorfismos comunes de la línea germinal (MAF >1%) para garantizar una distinción precisa entre mutaciones somáticas y variantes de la línea germinal, un requisito fundamental para el cálculo de TMB.

Cat.No.	IDENTIFICACIÓN	Valor TMB	Método
CBP80001-1	tTMB-P1	5.37	WES
CBP80001-2	tTMB-P2	9.84	WES
CBP80001-3	tTMB-P3	12.41	WES
CBP80001-4	tTMB-P4	21.09	WES
CBP80001-5	tTMB-P5	27.15	WES
CBP80001-6	tTMB-P6	8.98	WES
CBP80001-7	tTMB-P7	6.83	WES
CBP80001-8	tTMB-P8	27.15	WES
CBP80001-9	tTMB-P9	N / A	WES