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Personalización del producto estándar Fusion

¿Qué es la fusión genética?

Un gen de fusión ocurre cuando todas o parte de las secuencias de dos genes se fusionan para formar un nuevo gen. Esto puede ocurrir como resultado de una translocación cromosómica, una deleción intersticial o una inversión cromosómica.
 
 
 

Mecanismos de generación

Hay tres mecanismos comunes para la fusión de genes:
1) Translocación cromosómica. Como se muestra en la Figura A arriba, dos segmentos de los cromosomas 1 y 2 se cruzan, lo que resulta en la fusión del gen verde claro en el cromosoma 1 con el gen naranja en el cromosoma 2.

2) Eliminación intersticial. Como se muestra en la figura anterior, se produce una eliminación entre los genes naranja y verde claro en el cromosoma 3, lo que finalmente conduce a la fusión de los dos genes.

3) Inversión cromosómica. Por ejemplo, se produce una inversión entre los genes naranja y verde oscuro en el cromosoma 4, lo que finalmente conduce a la fusión de los genes naranja y verde claro.
 
Fuente de la imagen: Wikipedia
 

¿Por qué investigar fusiones?

Investigaciones anteriores han demostrado consistentemente que las fusiones genéticas están estrechamente asociadas con el desarrollo y la progresión de diversas enfermedades, particularmente el cáncer, e incluso pueden ser una causa directa de algunos cánceres. Por lo tanto, las fusiones de genes se han convertido en un área clave de investigación en el análisis de big data ómico actual.

Actualmente, se ha informado que muchos cánceres están estrechamente asociados con fusiones de genes, como se muestra en la siguiente tabla:
 
Tabla 1. Número de genes involucrados en la fusión en los principales subtipos de neoplasias
 
Medicamentos aprobados por la FDA dirigidos a fusiones genéticas en trastornos malignos (Fuente de la imagen: Mertens et al. Nature Reviews Cancer, 2015)
 

Enfoque de desarrollo de fusión

Si el sitio deseado no se puede encontrar en la muestra natural, podemos utilizar tecnología de ingeniería celular para editar ubicaciones cromosómicas específicas. La línea celular editada tiene puntos de interrupción claros y es completamente idéntica a la secuencia natural, lo que permite una detección estable a nivel de ARN y prueba la sensibilidad, especificidad y estabilidad de la detección de genes de fusión.
 
El proceso es el siguiente:
1. Ingeniería celular: Síntesis in vitro del fragmento del gen de fusión y transferencia a una muestra de células naturales para generar células que contengan la variante de fusión;

2. Amplificación: Cultivo celular y amplificación de pases;

3. Extracción: Se extrae el ARN de las células amplificadas;

4. Validación: La verificación del control de calidad se realiza mediante secuenciación Sanger y PCR digital. Si se requiere una prueba de fusión %AF o de número de copias, también realizamos una verificación dPCR.
 

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  Kits de PCR: PCR, Q-PCR , AMAS-PCR, DdPCR, PCR anidada...
  Kits NGS: WES, WGS, Panel
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