Estándar de referencia Panel-Ref® gDNA Cocktail V

 Descripción

El estándar de referencia gDNA Cocktail V contiene sitios importantes de genes comunes, que involucran 12 sitios de CNV de genes, como EGFR/BRAF/KRAS/PIK3CA/EML4-ALK/CCDC6-RET/ERBB2, que cubren múltiples tipos de variación, como SNP Del Translocation CNV, con una frecuencia de variación del 3 %, y calibración de dPCR.

 

Características

1. Las muestras se derivan de líneas celulares clínicamente aisladas, que se aproximan mucho a las características de los pacientes clínicos;

2. Cubre una variedad de sitios de mutación relacionados con el cáncer: cáncer de pulmón, cáncer colorrectal, cáncer de mama, cáncer gástrico, cáncer de ovario, cáncer de páncreas, etc.

3. calibración dPCR;

4. Contiene sitios importantes de genes comunes, que incluyen 12 sitios de CNV de genes.

 

información general

Nombre	Estándar de referencia Panel-Ref® gDNA Cocktail V
Gato. No.	CBP90014
Formato	ADNg
Tamaño	1ug/vial * 1 vial
Uso previsto	Sólo para uso en investigación
Estado del inventario	En stock
Buffer	Tris-EDTA
Condiciones de almacenamiento	2-8℃
Expiración	36 meses desde la fecha de fabricación.

Datos detallados

Gene	Cambio AA	Cambio de CDS	Exón	Identificación cósmica	%AF esperado	Posición del reloj (GRCh37)
EGFR	p.E746_A750delELREA	c.2235_2249del15 GGAATTAAGAGAAGC>-	19	COSM6223	3.0	chr7:55242465_55242479
EGFR	p.L858R	c.2573T>G	21	COSM6224	3.0	chr7:55259515
EGFR	p.T790M	c.2369C>T	20	COSM6240	3.0	chr7:55249071
EGFR	p.G719S	c.2155G>A	18	COSM6252	3.0	chr7:55241707
BRAF	p.V600E	c.1799T>A	15	COSM476	Mutaciones endógenas	chr7:140453136
KRAS	p.G12D	c.35G>A	2	COSM521	3.0	chr12:25398284
KRAS	p.Q61H	c.183A>C	3	COSM554	Mutaciones endógenas	chr12:25380275
PIK3CA	p.E545K	c.1633G>A	10	COSM763	3.0	chr3:178936091
PIK3CA	p.H1047R	c.3140A>G	20	COSM775	Mutaciones endógenas	chr3:178952085
EML4-ALK	E13-A20	Translocación de ADN	N / A	COSF408	3.0	N / A
CCDC6-RET	E1-E12	Translocación de ADN	N / A	COSF1271	3.0	N / A
ERBB2	CNV	Amplificación	N / A	N / A	CN=4	N / A

Aplicación del producto

 1.Cuantificación y control de calidad de ácidos nucleicos

2.Análisis de variación del número de copias de genes

3. Genotipado y detección de mutaciones: se utiliza para el desarrollo y validación de diversos ensayos de genotipado.

*Control positivo: en ensayos como ARMS-PCR, secuenciación Sanger y NGS, estos estándares proporcionan comparaciones claras de variantes mutantes y de tipo salvaje (p. ej., EGFR L858R, KRAS G12D).

*Determinación del límite de detección: Al mezclar estándares mutantes y naturales en una proporción específica, se puede determinar la sensibilidad del ensayo. Por ejemplo, determinar si se puede detectar una mutación de baja frecuencia del 1%, lo cual es crucial para las biopsias líquidas de tumores.

*Cuantificación de alelos: se utiliza para cuantificar con precisión las proporciones de diferentes alelos al analizar la metilación, el mosaicismo y otras condiciones.

4.Secuenciación de próxima generación

Los procesos NGS son muy complejos y los estándares de ADNg son fundamentales para el control de calidad durante todo el proceso.

*Control de calidad de la construcción de bibliotecas: como material de partida, los estándares de ADNg monitorean la eficiencia y la calidad de la construcción de bibliotecas.

*Comparación entre laboratorios: el uso del mismo conjunto de estándares permite la comparabilidad de los datos NGS entre diferentes laboratorios y plataformas.

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