Prueba de cáncer de ADN genómico estándar de referencia MSS

Descripción general del producto

La prueba de cáncer de ADN genómico estándar de referencia MSS es un material de referencia de ADN genómico (ADNg) altamente caracterizado diseñado para validar ensayos de detección de estabilidad de microsatélites (MSS) en el diagnóstico de cáncer. Derivado de líneas celulares bien caracterizadas con fenotipos estables de microsatélites confirmados, este estándar proporciona un control estándar para verificar el rendimiento de los flujos de trabajo de clasificación MSI/MSS. Con una validación integral en las plataformas qPCR y NGS, permite a los laboratorios clínicos garantizar la identificación precisa de tumores microsatélite estables, lo cual es fundamental para guiar las decisiones de inmunoterapia y las evaluaciones de pronóstico.

Características del producto

Perfil MSS verificado genómicamente

El estándar contiene ADN de líneas celulares con sistemas intactos de reparación de errores de coincidencia (MMR), que exhiben loci de microsatélites estables en los 6 marcadores recomendados (NR21, BAT26, BAT25, BAT27, NR24 y Mono27). La estabilidad de cada marcador se verifica mediante una cobertura NGS >1000x, lo que garantiza la confianza en la validación del ensayo.

Amplio rango de concentración

El ADNg, que se suministra a 40 ng/μL en tampón Tris-EDTA, se proporciona en convenientes alícuotas de 1 μg, lo que permite una dilución flexible para igualar las concentraciones de las muestras clínicas. Esto permite una simulación realista de diversas cantidades de entrada encontradas en las pruebas de rutina.

Validación multiplataforma

Validado para compatibilidad con todas las principales metodologías de detección de MSI, incluidas:

• Análisis de fragmentos multiplex basado en qPCR

• Paneles NGS específicos

• Inmunohistoquímica (IHC) para proteínas MMR

• Sistemas de electroforesis capilar

Uso

Calibración del ensayo

Utilice el estándar para establecer perfiles MSS de referencia para su plataforma de detección. Ejecute por triplicado junto con muestras de pacientes para verificar que los loci de microsatélites exhiban longitudes consistentes dentro del rango esperado para alelos estables.

Validación del método

Incorporar el estándar en los estudios de validación de métodos para:

• Determinar la especificidad del ensayo para la clasificación MSS

• Establecer reproducibilidad entre experimentos

• Verificar que no haya reactividad cruzada con muestras de MSI-H

• Calibrar umbrales de interpretación para llamadas MSI

Almacenamiento y preparación

Almacenar a -20°C para estabilidad a largo plazo (36 meses) o a 4°C por hasta 6 meses. Evite ciclos repetidos de congelación y descongelación realizando alícuotas en el primer uso. Diluir hasta la concentración de trabajo (normalmente 5-20 ng/μL) usando agua de grado de biología molecular o tampón TE.

Preguntas frecuentes

¿Qué líneas celulares se utilizan en este estándar?

El estándar se deriva de líneas celulares de mama caracterizadas con estado de MSS confirmado y expresión intacta de la proteína MMR. 

¿Cómo respalda esta norma las pruebas de ensayos clínicos?

Al proporcionar una referencia MSS consistente, el estándar garantiza que la clasificación MSI permanezca uniforme en los ensayos clínicos en múltiples sitios, lo que reduce la variabilidad entre laboratorios en la estratificación de pacientes para la elegibilidad para inmunoterapia.

¿Se puede utilizar con paneles NGS dirigidos a microsatélites?

Sí, el estándar está optimizado para su uso con paneles NGS específicos. Su ADNg de alta calidad genera una cobertura constante en todos los loci de microsatélites, lo que permite una evaluación precisa del rendimiento del panel.

¿Cuál es la diferencia entre este estándar y los controles MSS basados ​​en FFPE?

Mientras que los controles basados ​​en FFPE evalúan todo el flujo de trabajo, incluidos los efectos de fijación, este estándar de ADNg se centra específicamente en la fase de detección molecular, lo que permite a los laboratorios aislar y solucionar problemas de los pasos de amplificación y detección.

Cat.No.	IDENTIFICACIÓN	Estado de MSI	Formato	Cantidad	Buffer	Condiciones de almacenamiento	Detalles
CBP80002-1	MSS-1	MSS	ADN genómico	1ug+1ug	Tris-EDTA	2~8℃	Estándar de referencia MSS-P1 CBP80002-1.pdf
CBP80002-2	MSS-2	MSS	ADN genómico	1ug+1ug	Tris-EDTA	2~8℃	Estándar de referencia MSS-P2 CBP80002-2.pdf
CBP80002-3	MSS-3	MSS	ADN genómico	1ug+1ug	Tris-EDTA	2~8℃	Estándar de referencia MSS-P3 CBP80002-3.pdf
CBP80002-4	MSS-4	MSS	ADN genómico	1ug+1ug	Tris-EDTA	2~8℃	Estándar de referencia MSS-P4 CBP80002-4.pdf

Método	Contenido de la prueba	Ventajas	Desventajas
IHC	Detecta 4 proteínas MMR conocidas (MLH1, MSH2, MSH6 y PMS2)	Precio bajo, operación simple y rápida.	1) Es posible pasar por alto algunas anomalías causadas por otras proteínas MMR 2) Debido a la heterogeneidad del tumor, las puntuaciones de todo el tumor pueden ser inconsistentes
PCR	Detección de loci BAT25, BAT26, D2S123, D5S346 y D17S250	1)El estándar de oro para las pruebas 2)Evaluar objetivamente la actividad funcional de dMMR	1)Altos requisitos para las condiciones de laboratorio 2)Relativamente caro
NGS	Capaz de secuenciar cientos de miles a millones de moléculas genéticas al mismo tiempo.	1) Alto rendimiento, alta sensibilidad 2) Puede detectar mutaciones desconocidas	El análisis de datos posterior es difícil