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सीबीपी80002-1/2/3/4
सीबीपी80002-1/2/3/4
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एमएसएस संदर्भ मानक जीनोमिक डीएनए कैंसर परीक्षण एक अत्यधिक विशिष्ट जीनोमिक डीएनए (जीडीएनए) संदर्भ सामग्री है जिसे कैंसर निदान में माइक्रोसैटेलाइट स्थिरता (एमएसएस) का पता लगाने वाले परीक्षणों को मान्य करने के लिए डिज़ाइन किया गया है। पुष्टि किए गए माइक्रोसेटेलाइट स्थिर फेनोटाइप के साथ अच्छी तरह से विशेषता वाली सेल लाइनों से व्युत्पन्न, यह मानक एमएसआई/एमएसएस वर्गीकरण वर्कफ़्लो के प्रदर्शन को सत्यापित करने के लिए एक स्वर्ण-मानक नियंत्रण प्रदान करता है। क्यूपीसीआर और एनजीएस प्लेटफार्मों पर व्यापक सत्यापन के साथ, यह नैदानिक प्रयोगशालाओं को माइक्रोसैटेलाइट स्थिर ट्यूमर की सटीक पहचान सुनिश्चित करने में सक्षम बनाता है, जो इम्यूनोथेरेपी निर्णयों और पूर्वानुमान संबंधी आकलन के मार्गदर्शन के लिए महत्वपूर्ण है।
मानक में अक्षुण्ण बेमेल मरम्मत (एमएमआर) प्रणालियों के साथ सेल लाइनों से डीएनए शामिल है, जो सभी 6 अनुशंसित मार्करों (एनआर 21, बीएटी 26, बीएटी 25, बीएटी 27, एनआर 24 और मोनो 27) में स्थिर माइक्रोसैटेलाइट लोकी प्रदर्शित करता है। प्रत्येक मार्कर की स्थिरता 1000x एनजीएस कवरेज द्वारा सत्यापित की जाती है, जिससे परख सत्यापन में विश्वास सुनिश्चित होता है।
ट्रिस-ईडीटीए बफर में पर आपूर्ति की गई 40 एनजी/μL , जीडीएनए को सुविधाजनक 1 μg एलिकोट्स में प्रदान किया जाता है, जो नैदानिक नमूना सांद्रता से मेल खाने के लिए लचीले कमजोर पड़ने की अनुमति देता है। यह नियमित परीक्षण में आने वाली विभिन्न इनपुट मात्राओं का यथार्थवादी अनुकरण सक्षम बनाता है।
सभी प्रमुख एमएसआई पहचान पद्धतियों के साथ अनुकूलता के लिए मान्य, जिनमें शामिल हैं:
• मल्टीप्लेक्स क्यूपीसीआर-आधारित टुकड़ा विश्लेषण
• लक्षित एनजीएस पैनल
• एमएमआर प्रोटीन के लिए इम्यूनोहिस्टोकेमिस्ट्री (आईएचसी)।
• केशिका वैद्युतकणसंचलन प्रणाली
अपने डिटेक्शन प्लेटफॉर्म के लिए बेसलाइन एमएसएस प्रोफाइल स्थापित करने के लिए मानक का उपयोग करें। यह सत्यापित करने के लिए रोगी के नमूनों के साथ तीन प्रतियों में चलाएं कि माइक्रोसेटेलाइट लोकी स्थिर एलील्स के लिए अपेक्षित सीमा के भीतर लगातार लंबाई प्रदर्शित करता है।
विधि सत्यापन अध्ययन में मानक को शामिल करें:
• एमएसएस वर्गीकरण के लिए परख विशिष्टता निर्धारित करें
• रन-टू-रन प्रतिलिपि प्रस्तुत करने योग्यता स्थापित करें
• सत्यापित करें कि एमएसआई-एच नमूनों के साथ कोई क्रॉस-रिएक्टिविटी नहीं है
• एमएसआई कॉलिंग के लिए व्याख्या सीमा को कैलिब्रेट करें
पर या 6 महीने तक 4 डिग्री सेल्सियस पर स्टोर करें । -20 डिग्री सेल्सियस दीर्घकालिक स्थिरता (36 महीने) के लिए पहले उपयोग पर एलिकोटिंग द्वारा बार-बार जमने-पिघलने के चक्र से बचें। आणविक जीव विज्ञान-ग्रेड पानी या टीई बफर का उपयोग करके कार्यशील सांद्रता (आमतौर पर 5-20 एनजी/μL) तक पतला करें।
यह मानक पुष्टिकृत एमएसएस स्थिति और अक्षुण्ण एमएमआर प्रोटीन अभिव्यक्ति के साथ विशिष्ट स्तन कोशिका रेखाओं से लिया गया है।
एक सुसंगत एमएसएस संदर्भ प्रदान करके, मानक यह सुनिश्चित करता है कि एमएसआई वर्गीकरण बहु-साइट नैदानिक परीक्षणों में एक समान बना रहे, जिससे इम्यूनोथेरेपी पात्रता के लिए रोगी स्तरीकरण में अंतर-प्रयोगशाला परिवर्तनशीलता कम हो जाए।
हां, मानक को लक्षित एनजीएस पैनलों के साथ उपयोग के लिए अनुकूलित किया गया है। इसका उच्च-गुणवत्ता वाला जीडीएनए माइक्रोसैटेलाइट लोकी में लगातार कवरेज उत्पन्न करता है, जिससे पैनल के प्रदर्शन का सटीक मूल्यांकन संभव हो पाता है।
जबकि एफएफपीई-आधारित नियंत्रण निर्धारण प्रभावों सहित संपूर्ण वर्कफ़्लो का आकलन करते हैं, यह जीडीएनए मानक विशेष रूप से आणविक पहचान चरण पर ध्यान केंद्रित करता है, जिससे प्रयोगशालाओं को प्रवर्धन और पहचान चरणों को अलग करने और समस्या निवारण करने की अनुमति मिलती है।
बिल्ली.सं. |
पहचान |
एमएसआई स्थिति |
प्रारूप |
मात्रा |
बफर |
जमा करने की अवस्था |
विवरण |
सीबीपी80002-1 |
एमएसएस-1 |
एमएसएस |
जीनोमिक डीएनए | 1ug+1ug |
ट्रिस-ईडीटीए | 2~8℃ | |
सीबीपी80002-2 |
एमएसएस-2 |
एमएसएस |
जीनोमिक डीएनए |
1ug+1ug |
ट्रिस-ईडीटीए |
2~8℃ |
|
सीबीपी80002-3 |
एमएसएस-3 |
एमएसएस |
जीनोमिक डीएनए | 1ug+1ug |
ट्रिस-ईडीटीए | 2~8℃ | |
सीबीपी80002-4 |
एमएसएस-4 |
एमएसएस |
जीनोमिक डीएनए |
1ug+1ug |
ट्रिस-ईडीटीए |
2~8℃ |
तरीका |
परीक्षण सामग्री |
लाभ |
नुकसान |
आईएचसी |
4 ज्ञात एमएमआर प्रोटीन (एमएलएच1, एमएसएच2, एमएसएच6 और पीएमएस2) का पता लगाता है |
कम कीमत, सरल और तेज़ संचालन |
1) अन्य एमएमआर प्रोटीन के कारण होने वाली कुछ असामान्यताओं को छोड़ना संभव है |
पीसीआर |
BAT25, BAT26, D2S123, D5S346 और D17S250 लोकी का पता लगाना |
1) परीक्षण के लिए स्वर्ण मानक |
1)प्रयोगशाला स्थितियों के लिए उच्च आवश्यकताएं |
एनजीएस |
एक समय में सैकड़ों हजारों से लाखों जीन अणुओं को अनुक्रमित करने में सक्षम |
1) उच्च थ्रूपुट, उच्च संवेदनशीलता |
इसके बाद के डेटा का विश्लेषण कठिन है |
सामान्य जानकारी
बिल्ली.सं. |
पहचान |
एमएसआई स्थिति |
प्रारूप |
मात्रा |
बफर |
जमा करने की अवस्था |
विवरण |
सीबीपी80002-1 |
एमएसएस-1 |
एमएसएस |
जीनोमिक डीएनए | 1ug+1ug |
ट्रिस-ईडीटीए | 2~8℃ | |
सीबीपी80002-2 |
एमएसएस-2 |
एमएसएस |
जीनोमिक डीएनए |
1ug+1ug |
ट्रिस-ईडीटीए |
2~8℃ |
|
सीबीपी80002-3 |
एमएसएस-3 |
एमएसएस |
जीनोमिक डीएनए | 1ug+1ug |
ट्रिस-ईडीटीए | 2~8℃ | |
सीबीपी80002-4 |
एमएसएस-4 |
एमएसएस |
जीनोमिक डीएनए |
1ug+1ug |
ट्रिस-ईडीटीए |
2~8℃ |
पता लगाने के तरीके
एमएसआई अक्सर एमएमआर जीन उत्परिवर्तन और कार्यात्मक हानि के कारण होता है। इसलिए, कैंसर कोशिकाओं में एमएसआई का पता लगाते समय, हम यह निर्धारित कर सकते हैं कि एमएमआर जीन हानि का पता लगाकर एमएसआई होता है या नहीं, जैसे कि इम्यूनोहिस्टोकेमिस्ट्री तकनीक पर निर्भर प्रोटीन स्तर का पता लगाना, या सीधे एमएसआई के अनुक्रम परिवर्तनों का पता लगाना, जैसे आणविक स्तर का पता लगाना जैसे पीसीआर (पोलीमरेज़ चेन रिएक्शन) का पता लगाना।
तरीका |
परीक्षण सामग्री |
लाभ |
नुकसान |
आईएचसी |
4 ज्ञात एमएमआर प्रोटीन (एमएलएच1, एमएसएच2, एमएसएच6 और पीएमएस2) का पता लगाता है |
कम कीमत, सरल और तेज़ संचालन |
1) अन्य एमएमआर प्रोटीन के कारण होने वाली कुछ असामान्यताओं को छोड़ना संभव है |
पीसीआर |
BAT25, BAT26, D2S123, D5S346 और D17S250 लोकी का पता लगाना |
1) परीक्षण के लिए स्वर्ण मानक |
1)प्रयोगशाला स्थितियों के लिए उच्च आवश्यकताएं |
एनजीएस |
एक समय में सैकड़ों हजारों से लाखों जीन अणुओं को अनुक्रमित करने में सक्षम |
1) उच्च थ्रूपुट, उच्च संवेदनशीलता |
इसके बाद के डेटा का विश्लेषण कठिन है |
उत्पाद व्यवहार्यता
1. संबंधित आणविक पहचान प्रयोगों के लिए गुणवत्ता नियंत्रण उत्पाद
2. नई प्रायोगिक प्रक्रियाओं या किटों को अनुकूलित और सत्यापित करें
3.प्रायोगिक तरीकों की संवेदनशीलता, सटीकता और विशिष्टता का पता लगाना
4. विभिन्न प्लेटफार्मों के पहचान अंतर की तुलना करें