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सीबीपी80002-5/6/7/8/9/10/11/12
सीबीपी80002-5/6/7/8/9/10/11/12
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कैंसर परीक्षण के लिए एमएसआई -एच जीडीएनए संदर्भ मानक एक सावधानीपूर्वक चित्रित जीनोमिक डीएनए संदर्भ सामग्री है जिसे ऑन्कोलॉजी डायग्नोस्टिक्स में माइक्रोसैटेलाइट अस्थिरता-उच्च (एमएसआई-एच) पहचान परीक्षणों को मान्य करने के लिए डिज़ाइन किया गया है। बेमेल मरम्मत-कमी वाली सेल लाइनों से व्युत्पन्न, यह मानक लगभग 15% कोलोरेक्टल कैंसर और अन्य ट्यूमर प्रकारों में देखे गए हॉलमार्क माइक्रोसैटेलाइट अस्थिरता पैटर्न को प्रदर्शित करता है। अनुशंसित मार्करों में एक अच्छी तरह से परिभाषित एमएसआई-एच प्रोफ़ाइल के साथ, यह एमएसआई-एच ट्यूमर की सटीक पहचान सुनिश्चित करने के लिए एक आवश्यक नियंत्रण के रूप में कार्य करता है, जिसमें प्रतिरक्षा जांच बिंदु अवरोधकों के प्रति प्रतिक्रिया सहित विशिष्ट रोगसूचक और चिकित्सीय प्रभाव होते हैं।
मानक में 5 सर्वसम्मति मार्करों (NR21,BAT25, BAT26, NR27, NR24, और Mono27) में अस्थिर माइक्रोसैटेलाइट्स के साथ gDNA शामिल है। प्रत्येक स्थान विशिष्ट लंबाई भिन्नता प्रदर्शित करता है जो केशिका वैद्युतकणसंचलन और एनजीएस द्वारा सत्यापित एमएसआई-एच फेनोटाइप को परिभाषित करता है।
मानक की एमएसआई-एच स्थिति को एमएसआई स्कोर का उपयोग करके निर्धारित किया जाता है, जो परख सत्यापन के लिए एक संख्यात्मक आधार रेखा प्रदान करता है। यह प्रयोगशालाओं को एमएसआई-एच को एमएसएस और एमएसआई-लो नमूनों से अलग करने के लिए वस्तुनिष्ठ सीमाएं स्थापित करने की अनुमति देता है।
सत्यापन रन में मानक को शामिल करें:
• अस्थिर सूक्ष्म उपग्रहों के लिए पहचान संवेदनशीलता को सत्यापित करें
• एमएसआई-एच कॉलिंग थ्रेशोल्ड स्थापित करें
• समय के साथ परख प्रदर्शन की निगरानी करें
• विभिन्न प्लेटफार्मों या अभिकर्मक लॉटों पर परिणामों की तुलना करें
मानक सभी प्रमुख एमएसआई पहचान विधियों के साथ संगत है:
• क्यूपीसीआर द्वारा खंड विश्लेषण
• लक्षित एनजीएस पैनल
• इम्यूनोहिस्टोकेमिस्ट्री (जब एफएफपीई नियंत्रण के साथ जोड़ा जाता है)
• डिजिटल पीसीआर-आधारित माइक्रोसैटेलाइट विश्लेषण
मानक को 5-20 एनजी/μL तक पतला करें। अधिकांश परखों में इष्टतम प्रदर्शन के लिए एनजीएस अनुप्रयोगों के लिए अनुशंसित कम सांद्रता (5-10 एनजी/μL) और क्यूपीसीआर के लिए उच्च सांद्रता (10-20 एनजी/μL) के साथ, विशिष्ट प्लेटफ़ॉर्म आवश्यकताओं के आधार पर समायोजित करें।
मानक एमएसआई-एच के लिए बेथेस्डा दिशानिर्देश मानदंडों को पूरा करता है, 5 सर्वसम्मति माइक्रोसैटेलाइट मार्करों में से ≥2 में अस्थिरता का पता चला है। इस वर्गीकरण की पुष्टि आणविक परीक्षण और एमएमआर प्रोटीन की कमी के आकलन दोनों से होती है।
कच्चे सेल लाइन डीएनए के विपरीत, यह मानक बहुत सारे में लगातार एमएसआई-एच प्रोफाइल सुनिश्चित करने के लिए व्यापक लक्षण वर्णन और सामान्यीकरण से गुजरता है। इसमें कई प्लेटफार्मों पर सत्यापित प्रदर्शन डेटा शामिल है, जिससे सत्यापन में प्रयोगशालाओं का समय बचता है।
हां, जब वाइल्ड-टाइप प्लाज्मा सीएफडीएनए में पतला किया जाता है, तो मानक तरल बायोप्सी वर्कफ़्लो में एमएसआई का पता लगाने को मान्य कर सकता है। यह प्रयोगशालाओं को ट्यूमर डीएनए के प्रसार में एमएसआई मार्करों का पता लगाने की सीमा स्थापित करने में सक्षम बनाता है।
अधिकतम स्थिरता के लिए, -80°C पर 5 साल तक या -20°C पर 36 महीने तक स्टोर करें। डीएनए क्षरण को रोकने के लिए 5 से अधिक फ्रीज-पिघलना चक्रों से बचें। एकल-उपयोग वाले संस्करणों में अंशांकन की अनुशंसा की जाती है।
बिल्ली.सं. |
पहचान |
एमएसआई स्थिति |
प्रारूप |
मात्रा |
बफर |
जमा करने की अवस्था |
विवरण |
सीबीपी80002-5 |
एमएसआई-एच-यू1 |
एमएसआई-एच |
जीनोमिक डीएनए | 1ug+1ug |
ट्रिस-ईडीटीए | 2~8℃ | |
सीबीपी80002-6 |
एमएसआई-एच-यू2 |
एमएसआई-एच |
जीनोमिक डीएनए |
1ug+1ug |
ट्रिस-ईडीटीए |
2~8℃ |
|
सीबीपी80002-7 |
एमएसआई-एच-यू3 |
एमएसआई-एच |
जीनोमिक डीएनए | 1ug+1ug |
ट्रिस-ईडीटीए | 2~8℃ | |
सीबीपी80002-8 |
एमएसआई-एच-यू4 |
एमएसआई-एच |
जीनोमिक डीएनए |
1ug+1ug |
ट्रिस-ईडीटीए |
2~8℃ |
|
सीबीपी80002-9 |
एमएसआई-एच-यू5 |
एमएसआई-एच |
जीनोमिक डीएनए | 1ug+1ug |
ट्रिस-ईडीटीए | 2~8℃ | |
सीबीपी80002-10 |
एमएसआई-एच-यू6 |
एमएसआई-एच |
जीनोमिक डीएनए |
1ug+1ug |
ट्रिस-ईडीटीए |
2~8℃ |
|
सीबीपी80002-11 |
एमएसआई-एच-यू7 |
एमएसआई-एच |
जीनोमिक डीएनए | 1ug+1ug |
ट्रिस-ईडीटीए | 2~8℃ | |
सीबीपी80002-12 |
एमएसआई-एच-यू8 |
एमएसआई-एच |
जीनोमिक डीएनए |
1ug+1ug |
ट्रिस-ईडीटीए |
2~8℃ |
तरीका |
परीक्षण सामग्री |
लाभ |
नुकसान |
आईएचसी |
4 ज्ञात एमएमआर प्रोटीन (एमएलएच1, एमएसएच2, एमएसएच6 और पीएमएस2) का पता लगाता है |
कम कीमत, सरल और तेज़ संचालन |
1) अन्य एमएमआर प्रोटीन के कारण होने वाली कुछ असामान्यताओं को छोड़ना संभव है |
पीसीआर |
BAT25, BAT26, D2S123, D5S346 और D17S250 लोकी का पता लगाना |
1) परीक्षण के लिए स्वर्ण मानक |
1)प्रयोगशाला स्थितियों के लिए उच्च आवश्यकताएं |
एनजीएस |
एक समय में सैकड़ों हजारों से लाखों जीन अणुओं को अनुक्रमित करने में सक्षम |
1) उच्च थ्रूपुट, उच्च संवेदनशीलता |
इसके बाद के डेटा का विश्लेषण कठिन है |
सामान्य जानकारी
बिल्ली.सं. |
पहचान |
एमएसआई स्थिति |
प्रारूप |
मात्रा |
बफर |
जमा करने की अवस्था |
विवरण |
सीबीपी80002-5 |
एमएसआई-एच-यू1 |
एमएसआई-एच |
जीनोमिक डीएनए | 1ug+1ug |
ट्रिस-ईडीटीए | 2~8℃ | |
सीबीपी80002-6 |
एमएसआई-एच-यू2 |
एमएसआई-एच |
जीनोमिक डीएनए |
1ug+1ug |
ट्रिस-ईडीटीए |
2~8℃ |
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सीबीपी80002-7 |
एमएसआई-एच-यू3 |
एमएसआई-एच |
जीनोमिक डीएनए | 1ug+1ug |
ट्रिस-ईडीटीए | 2~8℃ | |
सीबीपी80002-8 |
एमएसआई-एच-यू4 |
एमएसआई-एच |
जीनोमिक डीएनए |
1ug+1ug |
ट्रिस-ईडीटीए |
2~8℃ |
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सीबीपी80002-9 |
एमएसआई-एच-यू5 |
एमएसआई-एच |
जीनोमिक डीएनए | 1ug+1ug |
ट्रिस-ईडीटीए | 2~8℃ | |
सीबीपी80002-10 |
एमएसआई-एच-यू6 |
एमएसआई-एच |
जीनोमिक डीएनए |
1ug+1ug |
ट्रिस-ईडीटीए |
2~8℃ |
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सीबीपी80002-11 |
एमएसआई-एच-यू7 |
एमएसआई-एच |
जीनोमिक डीएनए | 1ug+1ug |
ट्रिस-ईडीटीए | 2~8℃ | |
सीबीपी80002-12 |
एमएसआई-एच-यू8 |
एमएसआई-एच |
जीनोमिक डीएनए |
1ug+1ug |
ट्रिस-ईडीटीए |
2~8℃ |
पता लगाने के तरीके
पता लगाने के तरीके
एमएसआई अक्सर एमएमआर जीन उत्परिवर्तन और कार्यात्मक हानि के कारण होता है। इसलिए, कैंसर कोशिकाओं में एमएसआई का पता लगाते समय, हम यह निर्धारित कर सकते हैं कि एमएमआर जीन हानि का पता लगाकर एमएसआई होता है या नहीं, जैसे कि इम्यूनोहिस्टोकेमिस्ट्री तकनीक पर निर्भर प्रोटीन स्तर का पता लगाना, या सीधे एमएसआई के अनुक्रम परिवर्तनों का पता लगाना, जैसे आणविक स्तर का पता लगाना जैसे पीसीआर (पोलीमरेज़ चेन रिएक्शन) का पता लगाना।
तरीका |
परीक्षण सामग्री |
लाभ |
नुकसान |
आईएचसी |
4 ज्ञात एमएमआर प्रोटीन (एमएलएच1, एमएसएच2, एमएसएच6 और पीएमएस2) का पता लगाता है |
कम कीमत, सरल और तेज़ संचालन |
1) अन्य एमएमआर प्रोटीन के कारण होने वाली कुछ असामान्यताओं को छोड़ना संभव है |
पीसीआर |
BAT25, BAT26, D2S123, D5S346 और D17S250 लोकी का पता लगाना |
1) परीक्षण के लिए स्वर्ण मानक |
1)प्रयोगशाला स्थितियों के लिए उच्च आवश्यकताएं |
एनजीएस |
एक समय में सैकड़ों हजारों से लाखों जीन अणुओं को अनुक्रमित करने में सक्षम |
1) उच्च थ्रूपुट, उच्च संवेदनशीलता |
इसके बाद के डेटा का विश्लेषण कठिन है |
उत्पाद व्यवहार्यता
1. संबंधित आणविक पहचान प्रयोगों के लिए गुणवत्ता नियंत्रण उत्पाद
2. नई प्रायोगिक प्रक्रियाओं या किटों को अनुकूलित और सत्यापित करें
3.प्रायोगिक तरीकों की संवेदनशीलता, सटीकता और विशिष्टता का पता लगाना
4. विभिन्न प्लेटफार्मों के पहचान अंतर की तुलना करें